RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000108593.7

Ctdnep1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctdnep1, Length 1,627 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Dhrs1Q99L04 313 aa30.55■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cstf1Q99LC2 431 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Hnf1bP27889 558 aa30.54■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 CblbQ3TTA7 982 aa30.54■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Znhit6Q3UFB2 460 aaKnown RBP30.54■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Clec12aQ504P2 267 aa30.54■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Defb14Q7TNV9 67 aa30.54■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fam161aQ8QZV6 448 aa30.54■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Arhgef3Q91X46 524 aa30.54■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Prpsap1Q9D0M1 356 aa30.54■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Nsmce1Q9D720 266 aa30.54■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 B9d1Q9R1S0 204 aa30.54■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Asb1Q9WV74 336 aa30.54■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Wdfy3Q6VNB8 3508 aa30.53■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rgs22G3UYX5 1258 aa30.53■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 PenkP22005 268 aa30.53■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ap1g1P22892 822 aa30.53■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 AvpP35455 168 aa30.53■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Hsd17b1P51656 344 aa30.53■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Nrg2P56974 756 aa30.53■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Bahd1Q497V6 772 aa30.53■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ccdc25Q78PG9 208 aa30.53■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cfap61Q8CEL2 1252 aa30.53■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Apbb3Q8R1C9 486 aa30.53■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Vmn1r214Q8R279 367 aa30.53■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 ApofQ91V80 315 aa30.53■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Snf8Q9CZ28 258 aa30.53■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ogfod3Q9D136 315 aa30.53■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tssk3Q9D2E1 268 aa30.53■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 SelenovD3YXG1 328 aa30.52■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Vmn2r118E9Q1C1 853 aa30.52■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 BC051665E9Q623 330 aa30.52■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gad2P48320 585 aa30.52■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Q3TYS2 187 aa30.52■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Zfp560Q3URI6 754 aa30.52■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Soat1Q61263 540 aa30.52■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Znf148Q61624 794 aa30.52■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Deup1Q7M6Y5 601 aa30.52■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Disc1Q811T9 852 aa30.52■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Pcdhb13Q91Y06 796 aa30.52■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 4930449I24RikQ9D5E3 319 aa30.52■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Klrc2Q9WTJ9 238 aa30.52■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cldn34b1B1AZQ8 209 aa30.51■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rps3P62908 243 aaKnown RBP30.51■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ppm1lQ8BHN0 360 aa30.51■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fam110bQ8C739 366 aa30.51■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 C1raQ8CG16 707 aa30.51■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fam13bQ8K2H3 851 aa30.51■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Iqcf1Q9D9K8 182 aa30.51■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cldn34b2Q9D9N2 209 aa30.51■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 RecqlQ9Z129 648 aa30.51■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Lrrc6O88978 473 aa30.51■■■□□ 2.47
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Traf2P39429 501 aa30.51■■■□□ 2.47
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Casc4Q6P2L7 435 aa30.51■■■□□ 2.47
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cand1Q6ZQ38 1230 aa30.51■■■□□ 2.47
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Zbtb33Q8BN78 671 aa30.51■■■□□ 2.47
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tcaf2Q921K8 919 aa30.51■■■□□ 2.47
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ndufa10Q99LC3 355 aaKnown RBP30.51■■■□□ 2.47
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Klhl35Q9CZ49 574 aa30.51■■■□□ 2.47
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cdyl2Q9D5D8 503 aa30.51■■■□□ 2.47
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gprc5dQ9JIL6 344 aa30.51■■■□□ 2.47
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Morc3F7BJB9 942 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm20403G3UYB0 123 aa30.5■■■□□ 2.47
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Wsb2O54929 404 aa30.5■■■□□ 2.47
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 CopeO89079 308 aa30.5■■■□□ 2.47
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Timp2P25785 220 aa30.5■■■□□ 2.47
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Znf112Q0VAW7 879 aa30.5■■■□□ 2.47
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 A1bgQ19LI2 512 aa30.5■■■□□ 2.47
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Nlrp4fQ66X05 959 aa30.5■■■□□ 2.47
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Paxip1Q6NZQ4 1056 aa30.5■■■□□ 2.47
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Znf728Q6P5C7 752 aa30.5■■■□□ 2.47
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ddx51Q6P9R1 639 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tmem74Q8BQU7 305 aa30.5■■■□□ 2.47
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Bpifb6Q8BU51 449 aa30.5■■■□□ 2.47
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rnf222Q8CEF8 211 aa30.5■■■□□ 2.47
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Nae1Q8VBW6 534 aa30.5■■■□□ 2.47
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tm4sf5Q91XF2 196 aa30.5■■■□□ 2.47
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tas1r2Q925I4 843 aa30.5■■■□□ 2.47
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 MicalclQ9D5U9 680 aa30.5■■■□□ 2.47
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tk2Q9R088 270 aa30.5■■■□□ 2.47
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Auts2A0A087WPF7 1261 aa30.49■■■□□ 2.47
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Igkv12-46A0A140T8P6 115 aa30.49■■■□□ 2.47
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fbxo47A2A6H3 451 aa30.49■■■□□ 2.47
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 GzmkO35205 263 aa30.49■■■□□ 2.47
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 NmbrO54799 390 aa30.49■■■□□ 2.47
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Opa1P58281 960 aa30.49■■■□□ 2.47
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gpr149Q3UVY1 732 aa30.49■■■□□ 2.47
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Far2Q7TNT2 515 aa30.49■■■□□ 2.47
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Atp2c1Q80XR2 918 aa30.49■■■□□ 2.47
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Dyrk4Q8BI55 632 aa30.49■■■□□ 2.47
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Irak3Q8K4B2 609 aa30.49■■■□□ 2.47
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Abcg4Q91WA9 646 aa30.49■■■□□ 2.47
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gtpbp3Q923K4 492 aa30.49■■■□□ 2.47
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Hacl1Q9QXE0 581 aa30.49■■■□□ 2.47
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Nufip1Q9QXX8 484 aa30.49■■■□□ 2.47
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr271-ps1A0A1L1SQH2 283 aa30.48■■■□□ 2.47
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ccdc170D3YXL0 722 aa30.48■■■□□ 2.47
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 SmgcF6VRN1 385 aa30.48■■■□□ 2.47
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fgf14P70379 247 aa30.48■■■□□ 2.47
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 ManeaQ6NXH2 462 aa30.48■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.1 ms