RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000004201.7

Col5a3-201, Transcript of Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Col5a3, Length 6,119 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ctbp1O88712 441 aa14.51□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Trim40Q3UWA4 246 aa14.51□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Stk40Q7TNL3 435 aa14.51□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Pcid2Q8BFV2 399 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Baiap2Q8BKX1 535 aa14.51□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Unc93b1Q8VCW4 598 aa14.51□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Acsf2Q8VCW8 615 aa14.51□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Slc25a3Q8VEM8 357 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 HnrnpabQ99020 285 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Calm4Q9JM83 148 aa14.51□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Stap1Q9JM90 297 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Magea10A2AMW4 325 aa14.51□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ttll3A4Q9E5 927 aa14.51□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Kcnn4O89109 425 aa14.51□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Phkg1P07934 388 aa14.51□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Kcnh1Q60603 989 aa14.51□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Usf2Q64705 346 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Slc39a13Q8BZH0 361 aa14.51□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 BollQ924M5 281 aa14.51□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Spata9Q9D9R3 252 aa14.51□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Rpl38Q9JJI8 70 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 4931408C20RikE9PWP9 1381 aa14.51□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Vmn2r27D3YUK6 857 aa14.51□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Zc3h12bG3X9I7 835 aa14.51□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 ApoeP08226 311 aa14.51□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Tmem65Q4VAE3 234 aa14.51□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Plppr4Q7TME0 766 aa14.51□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Sytl5Q80T23 753 aa14.51□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Fndc11Q80WB0 326 aa14.51□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 CpzQ8R4V4 654 aa14.51□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Decr1Q9CQ62 335 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Det1Q9D0A0 550 aa14.51□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Akr1c12Q9JLI0 323 aa14.51□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Iigp1Q9QZ85 413 aa14.51□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Clcn2Q9R0A1 908 aa14.51□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Kcna10B2RQA1 511 aa14.51□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Mboat4P0C7A3 435 aa14.51□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Gon7P0C8B4 98 aa14.51□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Scn2bQ56A07 215 aa14.51□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Bnc2Q8BMQ3 1127 aa14.51□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Enpp4Q8BTJ4 456 aa14.51□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ace2Q8R0I0 805 aa14.51□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Olfr706Q9EPF8 316 aa14.51□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Fam83hQ148V8 1209 aa14.5□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Zfp957Q3UT76 567 aa14.5□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Phactr4Q501J7 694 aa14.5□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Zswim5Q80TC6 1188 aa14.5□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Sp8Q8BMJ8 486 aa14.5□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Chil4Q91Z98 402 aa14.5□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Tmem176aQ9DCS1 244 aa14.5□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 DguokQ9QX60 277 aa14.5□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Wnt8bQ9WUD6 350 aa14.5□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Disp2Q8CIP5 1345 aa14.5□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Gucy2dA0A0U1RPR8 1117 aa14.5□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa14.5□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Fkbp8O35465 402 aa14.5□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ptpn1P35821 432 aa14.5□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Syn2Q64332 586 aa14.5□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Olfr213Q7TS32 327 aa14.5□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Atl1Q8BH66 558 aa14.5□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Galnt18Q8K1B9 622 aa14.5□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Rsph14Q9D3W1 341 aa14.5□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Kctd4Q9D7X1 259 aa14.5□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Slc25a19Q9DAM5 318 aa14.5□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 XkQ9QXY7 446 aa14.5□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Klrc2Q9WTJ9 238 aa14.5□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Znf541Q0GGX2 1363 aa14.5□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ercc2O08811 760 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Kcnq1P97414 668 aa14.5□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 ChatQ03059 641 aa14.5□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Opa3Q505D7 179 aa14.5□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Tas2r102Q7M717 329 aa14.5□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 D3Ertd751eQ8BGN2 192 aa14.5□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Cnpy4Q8BQ47 245 aa14.5□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Snrnp25Q8VIK1 123 aa14.5□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Prdm15E9Q8T2 1174 aa14.5□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 AoahO35298 574 aa14.5□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Lilrb3P97484 841 aa14.5□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Stt3bQ3TDQ1 823 aa14.5□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Gpd2Q64521 727 aa14.5□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ddx52Q8K301 598 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Vmn1r203Q8R273 311 aa14.5□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Pcdhgb1Q91XX8 918 aa14.5□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Trappc5Q9CQA1 188 aa14.5□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Tmem138Q9D6G5 162 aa14.5□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Mta2Q9R190 668 aa14.5□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Slfn14V9GXG1 899 aa14.5□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Hcn4O70507 1186 aa14.5□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Yme1l1O88967 715 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 GlrbP48168 496 aa14.5□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ly9Q01965 654 aa14.5□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Fscn1Q61553 493 aa14.5□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 RfflQ6ZQM0 377 aa14.5□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ugt3a2Q8JZZ0 523 aa14.5□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Glis1Q8K1M4 789 aa14.5□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Impg1Q8R1W8 798 aa14.5□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Phf10Q9D8M7 497 aa14.5□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 PorcnQ9JJJ7 461 aa14.5□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Kctd18E0CZ26 429 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 68.8 ms