RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639482.1

SPIN3-222, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 3

Gene SPIN3, Length 3,719 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-222	ENST00000639482	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	SLCO4A1	Q96BD0	722 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	ADNP	Q9H2P0	1102 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	TTC3	P53804	2025 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482		I6L893	689 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	MAN1A2	O60476	641 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	BAIAP3	O94812	1187 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	CD52	P31358	61 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	SLC1A2	P43004	574 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	CDK9	P50750	372 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	CLCNKB	P51801	687 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	PHEX	P78562	749 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	RHD	Q02161	417 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	SULT2A1	Q06520	285 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	ZBTB6	Q15916	424 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	APPL2	Q8NEU8	664 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	USP3	Q9Y6I4	520 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	OR51F1	A6NGY5	319 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	EI24	O14681	340 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	HUS1	O60921	280 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	ZNF189	O75820	626 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	CHRNA1	P02708	482 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	ADRA1B	P35368	520 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	MAX	P61244	160 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	CTBS	Q01459	385 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	CDH17	Q12864	832 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	CYP51A1	Q16850	503 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	PKDCC	Q504Y2	493 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	CLEC14A	Q86T13	490 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	NRP2	O60462	931 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	IMPDH2	P12268	514 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	OXTR	P30559	389 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	LILRA4	P59901	499 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	PIM3	Q86V86	326 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	STYX	Q8WUJ0	223 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	KCNA7	Q96RP8	456 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	MUC3B	Q9H195	1237 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	OR12D3	Q9UGF7	316 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-222	ENST00000639482	ZBBX	A8MT70	800 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482		H3BMM5	538 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	MGEA5	O60502	916 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	OCM2	P0CE71	109 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	ECT2L	Q008S8	904 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	ITGAD	Q13349	1161 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	PMS2P3	Q13401	168 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	PERM1	Q5SV97	790 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	CNTD1	Q8N815	330 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	VPS33A	Q96AX1	596 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	GPR22	Q99680	433 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	ADI1	Q9BV57	179 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	RNF186	Q9NXI6	227 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	HAS3	O00219	553 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	CRCP	O75575	148 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	ASGR1	P07306	291 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	SETSIP	P0DME0	302 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	AKR1A1	P14550	325 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	UGT1A1	P22309	533 aa		10.08	□□□□□ -0.8

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms