RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	15.41	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	C1QA	P02745	245 aa		15.41	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	ALOX5	P09917	674 aa		15.41	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	ERCC2	P18074	760 aa		15.41	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	DCK	P27707	260 aa		15.41	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	RFC2	P35250	354 aa		15.41	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	NUMB	P49757	651 aa		15.41	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	PGF	P49763	221 aa		15.41	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	SMARCB1	Q12824	385 aa		15.41	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	KLF10	Q13118	480 aa		15.41	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	GK3P	Q14409	553 aa		15.41	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	HERC3	Q15034	1050 aa		15.41	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	BRMS1L	Q5PSV4	323 aa		15.41	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	PAOX	Q6QHF9	649 aa		15.41	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		15.41	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		15.41	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	15.41	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	PGAM4	Q8N0Y7	254 aa		15.41	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	15.41	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		15.41	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		15.41	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	15.41	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		15.41	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		15.41	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	C1orf50	Q9BV19	199 aa		15.41	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		15.41	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	DRC3	Q9H069	523 aa		15.41	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		15.41	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		15.41	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	IL37	Q9NZH6	218 aa		15.41	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	OR12D3	Q9UGF7	316 aa		15.41	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		15.41	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	RAD54B	Q9Y620	910 aa		15.41	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	MTMR11	A4FU01	709 aa		15.4	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	LSM1	O15116	133 aa	Known RBP	15.4	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	SNAP91	O60641	907 aa		15.4	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	15.4	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	15.4	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	ME2	P23368	584 aa		15.4	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	MAGEA6	P43360	314 aa		15.4	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	15.4	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		15.4	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		15.4	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		15.4	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	LGMN	Q99538	433 aa		15.4	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	PKP2	Q99959	881 aa		15.4	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		15.4	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	15.4	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		15.4	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	BRCA2	P51587	3418 aa		15.4	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	15.39	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	RGSL1	A5PLK6	1076 aa		15.39	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	CFAP99	D6REC4	459 aa		15.39	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	CLTB	P09497	229 aa		15.39	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	15.39	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	RXRG	P48443	463 aa		15.39	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	15.39	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	GLUD2	P49448	558 aa		15.39	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	15.39	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	NDST2	P52849	883 aa		15.39	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	ARPC4	P59998	168 aa		15.39	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	INSC	Q1MX18	579 aa		15.39	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		15.39	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	15.39	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		15.39	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	LILRA2	Q8N149	483 aa		15.39	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		15.39	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		15.39	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	15.39	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	VWCE	Q96DN2	955 aa		15.39	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF778	Q96MU6	729 aa		15.39	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	PSD2	Q9BQI7	771 aa		15.39	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	15.39	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	OLAH	Q9NV23	265 aa		15.39	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		15.39	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		15.39	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		15.39	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		15.39	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		15.39	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	GIPC1	O14908	333 aa		15.39	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	PFDN6	O15212	129 aa		15.39	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	METTL18	O95568	372 aa		15.39	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	APOE	P02649	317 aa		15.39	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	JAK1	P23458	1154 aa		15.39	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	CCR1	P32246	355 aa		15.39	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		15.39	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	15.39	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		15.39	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	CYS1	Q717R9	158 aa		15.39	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	FIBCD1	Q8N539	461 aa		15.39	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		15.39	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	NETO2	Q8NC67	525 aa		15.39	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	15.39	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		15.39	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		15.39	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		15.39	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	CWH43	Q9H720	699 aa		15.39	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	15.39	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	MRGBP	Q9NV56	204 aa		15.39	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	OSER1	Q9NX31	292 aa		15.39	■□□□□ 0.05

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