RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616449.1

ACSS3-208, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 3, human

Gene ACSS3, Length 3,833 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACSS3-208	ENST00000616449	CD1E	P15812	388 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	AOC1	P19801	751 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	ACVRL1	P37023	503 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	RAD51	Q06609	339 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	GTF2H3	Q13889	308 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	CCNI	Q14094	377 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	FAM47B	Q8NA70	645 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	METTL6	Q8TCB7	284 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	ZBTB18	Q99592	522 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	PKP2	Q99959	881 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	LY75	O60449	1722 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	CCDC189	A1A4V9	331 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	NR4A1	P22736	598 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	FLT3LG	P49771	235 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	GFM2	Q969S9	779 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	CDK15	Q96Q40	435 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	SORT1	Q99523	831 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	HAUS8	Q9BT25	410 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	HGH1	Q9BTY7	390 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	GJD2	Q9UKL4	321 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	ASGR1	P07306	291 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	FBXO30	Q8TB52	745 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	C2orf81	A6NN90	581 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	TMEM114	B3SHH9	223 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	AGRP	O00253	132 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	DCLK1	O15075	740 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	TLR5	O60602	858 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	GJB3	O75712	270 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	SPATA31D3	P0C874	917 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	RAP1GDS1	P52306	607 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	ALF	Q53S48	1182 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	RAET1E	Q8TD07	263 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	PPM1M	Q96MI6	270 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	SMIM14	Q96QK8	99 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449		A0A0J9YYE9	177 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	F2	P00734	622 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	PYGL	P06737	847 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	SLC2A4	P14672	509 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	AKT1	P31749	480 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	ANKS6	Q68DC2	871 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	CASS4	Q9NQ75	786 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	GID8	Q9NWU2	228 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	WWOX	Q9NZC7	414 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	TRIM38	O00635	465 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	NRP2	O60462	931 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	ARHGEF7	Q14155	803 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	C16orf87	Q6PH81	154 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	EPGN	Q6UW88	154 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	STK32C	Q86UX6	486 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	SLC25A23	Q9BV35	468 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	NMUR1	Q9HB89	426 aa		12.79	□□□□□ -0.36

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