RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613541.1

STX4-217, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

TSL 2

Gene STX4, Length 649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-217ENST00000613541 TRNP1Q6NT89 227 aa17.2■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa17.2■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 SEMA6CQ9H3T2 930 aa17.2■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa17.2■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 AGRPO00253 132 aa17.19■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 WT1P19544 449 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 MMP12P39900 470 aa17.19■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 PTPN9P43378 593 aa17.19■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 C16orf72Q14CZ0 275 aa17.19■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 MAN2A1Q16706 1144 aa17.19■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 PARP15Q460N3 678 aa17.19■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 EFHC2Q5JST6 749 aa17.19■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 TAF3Q5VWG9 929 aa17.19■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 FAM114A1Q8IWE2 563 aa17.19■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 RXFP2Q8WXD0 754 aa17.19■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 CPA5Q8WXQ8 436 aa17.19■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 OR1E3Q8WZA6 343 aa17.19■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 NKD1Q969G9 470 aa17.19■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 NTAN1Q96AB6 310 aa17.19■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 EFHD1Q9BUP0 239 aa17.19■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa17.19■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa17.18■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 SDK2Q58EX2 2172 aa17.18■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 FAM72CH0Y354 149 aa17.18■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 GPR3P46089 330 aa17.18■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 FOXK1P85037 733 aa17.18■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 AMZ1Q400G9 498 aa17.18■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 CCDC14Q49A88 953 aa17.18■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 FAM72AQ5TYM5 149 aa17.18■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 FAM72DQ6L9T8 149 aa17.18■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 FAM72BQ86X60 149 aa17.18■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 ZNF677Q86XU0 584 aa17.18■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 EMC1Q8N766 993 aa17.18■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 PAF1Q8N7H5 531 aa17.18■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 AGBL5Q8NDL9 886 aa17.18■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 DDA1Q9BW61 102 aa17.18■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 GSDMCQ9BYG8 508 aa17.18■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 TMEM168Q9H0V1 697 aa17.18■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa17.18■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 CYP4F12Q9HCS2 524 aa17.18■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 FGF22Q9HCT0 170 aa17.18■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 KCTD5Q9NXV2 234 aa17.18■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 MOSPD1Q9UJG1 213 aa17.18■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 TMEM202A6NGA9 273 aa17.17■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 RASA4BC9J798 803 aa17.17■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 INSIG1O15503 277 aa17.17■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 RASA4O43374 803 aa17.17■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 B4GAT1O43505 415 aa17.17■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 PIGNO95427 931 aa17.17■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 CCL4P13236 92 aa17.17■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 CR2P20023 1033 aa17.17■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 EPHB2P29323 1055 aa17.17■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 SERPINA4P29622 427 aa17.17■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 ALDH4A1P30038 563 aa17.17■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP17.17■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 TRIM23P36406 574 aa17.17■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 CSNK1DP48730 415 aa17.17■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 NOMO3P69849 1222 aa17.17■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP17.17■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 NCAPHQ15003 741 aa17.17■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 SKIDA1Q1XH10 827 aa17.17■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 C2CD6Q53TS8 623 aa17.17■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 NAA35Q5VZE5 725 aa17.17■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 ZNF438Q7Z4V0 828 aa17.17■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 SLFN11Q7Z7L1 901 aa17.17■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa17.17■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 EPN3Q9H201 632 aa17.17■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 WDR26Q9H7D7 661 aa17.17■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa17.17■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 RDH14Q9HBH5 336 aa17.17■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 LHX3Q9UBR4 397 aa17.17■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 C2CD4BA6NLJ0 364 aa17.16■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 ELFN1P0C7U0 828 aa17.16■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 CCNB1P14635 433 aa17.16■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 MAN1A1P33908 653 aa17.16■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 LIMK2P53671 638 aa17.16■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 OR1D5P58170 312 aa17.16■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 RAB15P59190 212 aa17.16■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 NR1D2Q14995 579 aa17.16■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 CYTH1Q15438 398 aa17.16■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa17.16■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa17.16■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 PLA2G15Q8NCC3 412 aa17.16■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 OR4D9Q8NGE8 314 aa17.16■□□□□ 0.34
STX4-217ENST00000613541 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms