RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 GDPD5Q8WTR4 605 aa20.25■□□□□ 0.83
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CTDP1-208ENST00000613122 FAM58BPP0C7Q3 252 aa20.25■□□□□ 0.83
CTDP1-208ENST00000613122 TRIM16LQ309B1 348 aa20.25■□□□□ 0.83
CTDP1-208ENST00000613122 TRAF7Q6Q0C0 670 aa20.25■□□□□ 0.83
CTDP1-208ENST00000613122 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa20.25■□□□□ 0.83
CTDP1-208ENST00000613122 OR8H2Q8N162 312 aa20.25■□□□□ 0.83
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CTDP1-208ENST00000613122 RANBP1P43487 201 aa20.23■□□□□ 0.83
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CTDP1-208ENST00000613122 TEKT5Q96M29 485 aa20.23■□□□□ 0.83
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CTDP1-208ENST00000613122 RAI2Q9Y5P3 530 aa20.23■□□□□ 0.83
CTDP1-208ENST00000613122 TMEM191CA6NGB0 347 aa20.23■□□□□ 0.83
CTDP1-208ENST00000613122 TAPT1Q6NXT6 567 aa20.23■□□□□ 0.83
CTDP1-208ENST00000613122 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CTDP1-208ENST00000613122 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CTDP1-208ENST00000613122 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
CTDP1-208ENST00000613122 PIPSLA2A3N6 862 aa20.22■□□□□ 0.83
CTDP1-208ENST00000613122 RPP40O75818 363 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CTDP1-208ENST00000613122 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CTDP1-208ENST00000613122 TSPAN8P19075 237 aa20.22■□□□□ 0.83
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