RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606352.1

RNU6-90P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 90, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-90P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-90P-201ENST00000606352 GLIS1Q8NBF1 620 aa0.54□□□□□ -2.32
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RNU6-90P-201ENST00000606352 DUSP19Q8WTR2 217 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
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RNU6-90P-201ENST00000606352 MGEA5O60502 916 aa0.52□□□□□ -2.33
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RNU6-90P-201ENST00000606352 RFPL1O75677 317 aa0.52□□□□□ -2.33
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RNU6-90P-201ENST00000606352 LYL1P12980 280 aa0.52□□□□□ -2.33
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RNU6-90P-201ENST00000606352 ITIH1P19827 911 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 ITGAXP20702 1163 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 KLRK1P26718 216 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 DRD3P35462 400 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 SNX16P57768 344 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP0.52□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 ISL1P61371 349 aa0.52□□□□□ -2.33
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