RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000605847.5

NEDD8-MDP1-204, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 5

Gene NEDD8-MDP1, Length 758 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PRDM8Q9NQV8 689 aa15.48■□□□□ 0.07
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PILRAQ9UKJ1 303 aa15.48■□□□□ 0.07
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa15.47■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 UNC13CQ8NB66 2214 aa15.46■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TTLL8A6PVC2 850 aa15.46■□□□□ 0.07
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP15.46■□□□□ 0.073e-7■■□□□ 13.3
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NR1D2Q14995 579 aa15.46■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 UGP2Q16851 508 aa15.46■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GSDMCQ9BYG8 508 aa15.46■□□□□ 0.07
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PCDH12Q9NPG4 1184 aa15.46■□□□□ 0.07
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP15.46■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LRP4O75096 1905 aa15.45■□□□□ 0.06
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HCAR2Q8TDS4 363 aa15.45■□□□□ 0.06
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PDCL3Q9H2J4 239 aa15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RETREG1Q9H6L5 497 aa15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 OR12D3Q9UGF7 316 aa15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CHD5Q8TDI0 1954 aa15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PRSS38A1L453 326 aa15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 BECN2A8MW95 431 aa15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KDELR3O43731 214 aa15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PRKCGP05129 697 aa15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FGF1P05230 155 aa15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PEX6Q13608 980 aa15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GRM3Q14832 879 aa15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ARTNQ5T4W7 220 aa15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GJB7Q6PEY0 223 aa15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CPT1CQ8TCG5 803 aa15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SMARCE1Q969G3 411 aa15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RTP4Q96DX8 246 aa15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CTRCQ99895 268 aa15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZPBPQ9BS86 351 aa15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SUV39H2Q9H5I1 410 aa15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 WDR26Q9H7D7 661 aa15.44■□□□□ 0.06
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