RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 B8ZZF3 427 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 KCNK1O00180 336 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 CD160O95971 181 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 C1SP09871 688 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 PTPN3P26045 913 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 SNX1Q13596 522 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF234Q14588 700 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 TEX44Q53QW1 395 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 RALGPS1Q5JS13 557 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 C4orf22Q6V702 233 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 TMPRSS6Q8IU80 811 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM181AQ8N9Y4 354 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 SIPA1Q96FS4 1042 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC114Q96M63 670 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM121Q9BTD3 319 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 SUN2Q9UH99 717 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM131Q92545 1883 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 CTAGE15A4D2H0 777 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 RNF103O00237 685 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 GAS8O95995 478 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 GSRP00390 522 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 MT-CO1P00395 513 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 CTAGE8P0CG41 777 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 CES1P23141 567 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 STK19P49842 368 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC10A7Q0GE19 358 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 WASHC5Q12768 1159 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 P3H1Q32P28 736 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 C22orf39Q6P5X5 142 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 CTAGE6Q86UF2 777 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 CTAGE4Q8IX94 777 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 SORCS1Q8WY21 1168 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 MYO19Q96H55 970 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM245Q9H330 911 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 SEPT10Q9P0V9 454 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 GCATO75600 419 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 JCHAINP01591 159 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 ACTN2P35609 894 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 GRIA4P48058 902 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 CSNK1DP48730 415 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 RHOAP61586 193 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 RHDQ02161 417 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 CYTH1Q15438 398 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 DLG2Q15700 870 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 ALG1LQ6GMV1 187 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 TTC27Q6P3X3 843 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC89Q8N998 374 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 FRS2Q8WU20 508 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 TEKT5Q96M29 485 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 SPATA13Q96N96 652 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 MGME1Q9BQP7 344 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 UNC79Q9P2D8 2635 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-214ENST00000592483 H0Y8X5 98 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-214ENST00000592483 WISP1O95388 367 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-214ENST00000592483 ECEL1O95672 775 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-214ENST00000592483 IGSF6O95976 241 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-214ENST00000592483 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-214ENST00000592483 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-214ENST00000592483 ZBTB17Q13105 803 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-214ENST00000592483 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-214ENST00000592483 ACCSLQ4AC99 568 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-214ENST00000592483 LEKR1Q6ZMV7 388 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-214ENST00000592483 GSTA5Q7RTV2 222 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-214ENST00000592483 SPACA3Q8IXA5 215 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM71DQ8N9W8 422 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-214ENST00000592483 CCHCR1Q8TD31 782 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-214ENST00000592483 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-214ENST00000592483 FBRSQ9HAH7 460 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-214ENST00000592483 LHX3Q9UBR4 397 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-214ENST00000592483 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-214ENST00000592483 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
CAPNS1-214ENST00000592483 DFNA5O60443 496 aa23.81■■□□□ 1.4
CAPNS1-214ENST00000592483 ACADMP11310 421 aa23.81■■□□□ 1.4
CAPNS1-214ENST00000592483 IL12RB1P42701 662 aa23.81■■□□□ 1.4
CAPNS1-214ENST00000592483 KCNJ1P48048 391 aa23.81■■□□□ 1.4
CAPNS1-214ENST00000592483 NUMBP49757 651 aa23.81■■□□□ 1.4
CAPNS1-214ENST00000592483 CLDN6P56747 220 aa23.81■■□□□ 1.4
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC14A2Q15849 920 aa23.81■■□□□ 1.4
CAPNS1-214ENST00000592483 MAATS1Q7Z4T9 603 aa23.81■■□□□ 1.4
CAPNS1-214ENST00000592483 OR2AP1Q8NGE2 309 aa23.81■■□□□ 1.4
CAPNS1-214ENST00000592483 LRRN4Q8WUT4 740 aa23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.4 ms