RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 BRAT1Q6PJG6 821 aa31.18■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa31.18■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa31.18■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC26A11Q86WA9 606 aa31.18■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF778Q96MU6 729 aa31.18■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 CENPHQ9H3R5 247 aa31.18■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP31.18■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 OGFRQ9NZT2 677 aa31.18■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 WASF2Q9Y6W5 498 aa31.18■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A0J9YYE9 177 aa31.17■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 SMIM23A6NLE4 172 aa31.17■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 TRBC1P01850 177 aa31.17■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 GKP32189 559 aa31.17■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa31.17■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNMB4Q86W47 210 aa31.17■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 CTAGE3PQ8IX95 158 aa31.17■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 CHST14Q8NCH0 376 aa31.17■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNV2Q8TDN2 545 aa31.17■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 ARL8AQ96BM9 186 aa31.17■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 LYSMD1Q96S90 227 aa31.17■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 ZFATQ9P243 1243 aa31.17■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 H3BQF6 201 aa31.16■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 PSMA3P25788 255 aa31.16■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 SOX9P48436 509 aa31.16■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 ENPP2Q13822 863 aa31.16■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP31.16■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 PPM1NQ8N819 430 aa31.16■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP31.16■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 DKK3Q9UBP4 350 aa31.16■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 TSPAN11A1L157 253 aa31.15■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF40O75150 1001 aa31.15■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 PRNPP04156 253 aa31.15■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 UGT2B4P06133 528 aa31.15■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP31.15■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP31.15■■■□□ 2.584e-8■■■■■ 41.9
CAPNS1-206ENST00000588815 CNGA3Q16281 694 aa31.15■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 TTMPQ5BVD1 217 aa31.15■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 LGSNQ5TDP6 509 aa31.15■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 LMNTD2Q8IXW0 634 aa31.15■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 DCAKDQ8WVC6 231 aa31.15■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 OR8D1Q8WZ84 308 aa31.15■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 SMYD2Q9NRG4 433 aa31.15■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 SPO11Q9Y5K1 396 aa31.15■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 F5P12259 2224 aa31.15■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC7A4O43246 635 aa31.14■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 LPOP22079 712 aaPredicted RBP31.14■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC8A1P32418 973 aa31.14■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP31.14■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 SERPINB9P50453 376 aa31.14■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 RASSF3Q86WH2 238 aa31.14■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 TMIEQ8NEW7 156 aa31.14■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 CALML6Q8TD86 181 aa31.14■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa31.14■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP31.14■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 PIAS3Q9Y6X2 628 aa31.14■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 XIRP2A4UGR9 3374 aa31.14■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 CAPN8A6NHC0 703 aa31.14■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 LEFTY1O75610 366 aa31.14■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 DRD1P21728 446 aa31.14■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 CNTFP26441 200 aa31.14■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 C9orf64Q5T6V5 341 aa31.14■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 USP45Q70EL2 814 aa31.14■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 SFTPA1Q8IWL2 248 aa31.14■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 CNTN4Q8IWV2 1026 aa31.14■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 MDGA1Q8NFP4 955 aa31.14■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 OR13J1Q8NGT2 312 aa31.14■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 ZBTB9Q96C00 473 aa31.14■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 TLCD1Q96CP7 247 aa31.14■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 SCRN2Q96FV2 425 aa31.14■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 KLHL32Q96NJ5 620 aa31.14■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP31.14■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 ARL5AQ9Y689 179 aa31.14■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa31.13■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP31.13■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 SIN3BO75182 1162 aa31.13■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 PRKCGP05129 697 aa31.13■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 PIRTP0C851 137 aa31.13■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 ERVK-10P10266 1014 aa31.13■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 SRFP11831 508 aa31.13■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 OAS2P29728 719 aaKnown RBP31.13■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 IL12RB1P42701 662 aa31.13■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP31.13■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 TDGQ13569 410 aa31.13■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF805Q5CZA5 627 aa31.13■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 TAOK1Q7L7X3 1001 aa31.13■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 DSG4Q86SJ6 1040 aa31.13■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 UNC5BQ8IZJ1 945 aa31.13■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP31.13■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 CPNE1Q99829 537 aa31.13■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM167BQ9BTA0 163 aa31.13■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP31.13■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 TXNDC16Q9P2K2 825 aa31.13■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF711Q9Y462 761 aa31.13■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 ATG2BQ96BY7 2078 aa31.12■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 LOC730098B7Z3J9 87 aa31.12■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 VAPBO95292 243 aa31.12■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 HMGCLP35914 325 aa31.12■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 HADHAP40939 763 aa31.12■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 PRAMEP78395 509 aa31.12■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 ARSIQ5FYB1 569 aa31.12■■■□□ 2.57
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