RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TANC1Q9C0D5 1861 aa16.57■□□□□ 0.24
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC11A2P49281 568 aa16.54■□□□□ 0.24
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PPM1LQ5SGD2 360 aa16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMEM198Q66K66 360 aa16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NXNQ6DKJ4 435 aa16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MRNIPQ6NTE8 343 aa16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IRGCQ6NXR0 463 aa16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ISCA2Q86U28 154 aa16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KBTBD2Q8IY47 623 aa16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CFAP52Q8N1V2 620 aa16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PELI3Q8N2H9 469 aa16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PNPLA1Q8N8W4 532 aa16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MIEF2Q96C03 454 aa16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
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