RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570139.1

CNOT1-222, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 1, human

TSL 2

Gene CNOT1, Length 458 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT1-222	ENST00000570139	KRT39	Q6A163	491 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	ANO7	Q6IWH7	933 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	MED25	Q71SY5	747 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	RPAIN	Q86UA6	219 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	PWWP2A	Q96N64	755 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	FNBP1	Q96RU3	617 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	DIRC2	Q96SL1	478 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	TLR10	Q9BXR5	811 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	GCNT4	Q9P109	453 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	KCND3	Q9UK17	655 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	VPS28	Q9UK41	221 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	BAG5	Q9UL15	447 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	USP22	Q9UPT9	525 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	TTC26	A0AVF1	554 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	CCDC78	A2IDD5	438 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	STX16	O14662	325 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	DHH	O43323	396 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	TRIM13	O60858	407 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	GUCY1B2	O75343	617 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	ITGAL	P20701	1170 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	ABCD3	P28288	659 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	CASP4	P49662	377 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	GALNT2	Q10471	571 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	MYO1E	Q12965	1108 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	DRP2	Q13474	957 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	RNF151	Q2KHN1	245 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	R3HCC1L	Q7Z5L2	792 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	TRABD2A	Q86V40	505 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	CD302	Q8IX05	232 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	RNF169	Q8NCN4	708 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	SPAG5	Q96R06	1193 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	TCHP	Q9BT92	498 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	CENPO	Q9BU64	300 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	SGPP1	Q9BX95	441 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	SETD4	Q9NVD3	440 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	VPS51	Q9UID3	782 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	ATP8B3	O60423	1300 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	STC2	O76061	302 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	ASGR1	P07306	291 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	CCDC175	P0C221	793 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	HK1	P19367	917 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	CHRM3	P20309	590 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	GCSH	P23434	173 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	RBL1	P28749	1068 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	PGD	P52209	483 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	ZNF134	P52741	427 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	BEX3	Q00994	111 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	7.36	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	CCNI	Q14094	377 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	EPC2	Q52LR7	807 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	NOTUM	Q6P988	496 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		7.36	□□□□□ -1.23

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