RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567642.1

PPP4C-211, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 658 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-211ENST00000567642 HK3P52790 923 aa21.07■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 AP1S1P61966 158 aa21.07■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 ELOCQ15369 112 aa21.07■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 ALG11Q2TAA5 492 aa21.07■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa21.07■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 SLC35F3Q8IY50 421 aa21.07■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 ATL2Q8NHH9 583 aa21.07■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 FGF11Q92914 225 aa21.07■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 ECHDC3Q96DC8 303 aa21.07■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF599Q96NL3 588 aa21.07■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 CSPG4P5Q96PW8 444 aa21.07■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 PSKH2Q96QS6 385 aa21.07■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 GULP1Q9UBP9 304 aa21.07■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 KLQ9UEF7 1012 aa21.07■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 CAPN11Q9UMQ6 739 aa21.07■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 KIF26BQ2KJY2 2108 aa21.07■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 A0A087X0T9 212 aa21.06■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 MPOP05164 745 aa21.06■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 FAM228BP0C875 321 aa21.06■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 SRP54P61011 504 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 GABREP78334 506 aa21.06■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 RALGDSQ12967 914 aa21.06■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 MTM1Q13496 603 aa21.06■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 KRT81Q14533 505 aa21.06■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 AGERQ15109 404 aa21.06■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 PERM1Q5SV97 790 aa21.06■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 LIPIQ6XZB0 460 aa21.06■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 BBS5Q8N3I7 341 aa21.06■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 ATPAF2Q8N5M1 289 aa21.06■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 PLA2G15Q8NCC3 412 aa21.06■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 NSMCE1Q8WV22 266 aa21.06■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 TEKT4Q8WW24 435 aa21.06■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 WDR92Q96MX6 357 aa21.06■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa21.06■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 IFNKQ9P0W0 207 aa21.06■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 SIRPGQ9P1W8 387 aa21.06■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 CFAP69A5D8W1 941 aa21.05■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 TNFP01375 233 aa21.05■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 ALPIP09923 528 aa21.05■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 ACOX1Q15067 660 aa21.05■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 TBC1D25Q3MII6 688 aa21.05■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 CCDC122Q5T0U0 273 aa21.05■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 NYAP1Q6ZVC0 841 aa21.05■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 DPPA4Q7L190 304 aa21.05■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 TPCN2Q8NHX9 752 aa21.05■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 NAT6Q93015 286 aa21.05■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 IQCDQ96DY2 449 aa21.05■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 NSMCE3Q96MG7 304 aa21.05■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 PCDH18Q9HCL0 1135 aa21.05■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 PADI4Q9UM07 663 aa21.05■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa21.05■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 MYO1FO00160 1098 aa21.04■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 CYP1A2P05177 515 aa21.04■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 SERPINB6P35237 376 aa21.04■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 CDH6P55285 790 aa21.04■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 CCDC173Q0VFZ6 552 aa21.04■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 ISXQ2M1V0 245 aa21.04■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 GKN2Q86XP6 184 aa21.04■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 NIPA2Q8N8Q9 360 aa21.04■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 PCDH19Q8TAB3 1148 aa21.04■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 B4GALT6Q9UBX8 382 aa21.04■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 MAFKO60675 156 aa21.03■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 CPP00450 1065 aa21.03■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 GJC1P36383 396 aa21.03■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 MAXP61244 160 aa21.03■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 HADHQ16836 314 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 DENND2CQ68D51 928 aa21.03■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 PGBD5Q8N414 524 aa21.03■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 PDXPQ96GD0 296 aa21.03■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 NUDCD1Q96RS6 583 aa21.03■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 CCDC3Q9BQI4 270 aa21.03■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa21.03■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 MOSPD1Q9UJG1 213 aa21.03■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 GPR34Q9UPC5 381 aa21.03■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 A0A1W2PQ67 120 aa21.02■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 PEX11BO96011 259 aa21.02■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 GYPCP04921 128 aa21.02■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 CASP14P31944 242 aa21.02■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 MMP13P45452 471 aa21.02■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 LSSP48449 732 aa21.02■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 MMRN1Q13201 1228 aa21.02■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 C3orf38Q5JPI3 329 aa21.02■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 MARC1Q5VT66 337 aa21.02■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 LVRNQ6Q4G3 990 aa21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms