RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 RAPGEF5Q92565 580 aa17.19■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 HDAC11Q96DB2 347 aa17.19■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 RBSNQ9H1K0 784 aa17.19■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 USP29Q9HBJ7 922 aa17.19■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 EVA1BQ9NVM1 165 aa17.19■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa17.19■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 PHTF1Q9UMS5 762 aa17.19■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 CPP00450 1065 aa17.18■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 ACP1P24666 158 aa17.18■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 HTR1BP28222 390 aa17.18■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 BLKP51451 505 aa17.18■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 RALGDSQ12967 914 aa17.18■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 WSCD2Q2TBF2 565 aa17.18■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 ODF2Q5BJF6 829 aa17.18■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 LIPIQ6XZB0 460 aa17.18■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 NDUFAF2Q8N183 169 aa17.18■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM181AQ8N9Y4 354 aa17.18■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 NT5MQ9NPB1 228 aa17.18■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 UCKL1Q9NWZ5 548 aa17.18■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 DTLQ9NZJ0 730 aa17.18■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa17.18■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 BAHCC1Q9P281 2608 aa17.18■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 SHROOM3Q8TF72 1996 aa17.17■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRIM38O00635 465 aa17.17■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 SIGLEC6O43699 453 aa17.17■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 SPOPO43791 374 aa17.17■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 NEBLO76041 1014 aa17.17■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCNB1P14635 433 aa17.17■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 JUNDP17535 347 aa17.17■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 CA4P22748 312 aa17.17■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 FECHP22830 423 aa17.17■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 ATRXP46100 2492 aa17.17■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 MAXP61244 160 aa17.17■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 GBE1Q04446 702 aa17.17■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARMC12Q5T9G4 340 aa17.17■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC9A4Q6AI14 798 aa17.17■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMPRSS12Q86WS5 348 aa17.17■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 NSMCE3Q96MG7 304 aa17.17■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 SPASTQ9UBP0 616 aa17.17■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 B4GALT6Q9UBX8 382 aa17.17■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 COQ6Q9Y2Z9 468 aa17.17■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 PPIL1Q9Y3C6 166 aa17.17■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa17.17■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 LRRK1Q38SD2 2015 aa17.16■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 PSMD11O00231 422 aa17.16■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 TPP1O14773 563 aa17.16■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 APOL1O14791 398 aa17.16■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 AQP9O43315 295 aa17.16■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 PSTPIP1O43586 416 aa17.16■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 PGLSO95336 258 aa17.16■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRT1P04264 644 aa17.16■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRKCGP05129 697 aa17.16■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 GIMD1P0DJR0 217 aa17.16■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 VIPR1P32241 457 aa17.16■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 HNF1BP35680 557 aa17.16■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 NOP2P46087 812 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 ITKQ08881 620 aa17.16■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRAF2Q12933 501 aa17.16■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 DNAJC3Q13217 504 aa17.16■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 NFATC4Q14934 902 aa17.16■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF542PQ5EBM4 170 aa17.16■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 TPRG1LQ5T0D9 272 aa17.16■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 DHRS13Q6UX07 377 aa17.16■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 USP45Q70EL2 814 aa17.16■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMTC1Q8IUR5 882 aa17.16■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCDC13Q8IYE1 715 aa17.16■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 PHACTR4Q8IZ21 702 aa17.16■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa17.16■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 PLD5Q8N7P1 536 aa17.16■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCNYQ8ND76 341 aa17.16■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 SCRN2Q96FV2 425 aa17.16■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 SEMA3CQ99985 751 aa17.16■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 APOOQ9BUR5 198 aa17.16■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC13A1Q9BZW2 595 aa17.16■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 BRD8Q9H0E9 1235 aa17.16■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP17.16■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 DNPEPQ9ULA0 475 aa17.16■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa17.16■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 PTPRBP23467 1997 aa17.16■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 PKD1L2Q7Z442 2459 aa17.15■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 K7ESM1 405 aa17.15■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 FFAR2O15552 330 aa17.15■□□□□ 0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms