RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	PEX13	Q92968	403 aa		18.49	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	HMCES	Q96FZ2	354 aa		18.49	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	ASB2	Q96Q27	587 aa		18.49	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	PKP2	Q99959	881 aa		18.49	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		18.49	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	C8B	P07358	591 aa		18.49	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	18.49	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	ACADVL	P49748	655 aa		18.49	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	NFKB2	Q00653	900 aa		18.49	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		18.49	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		18.49	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF280D	Q6N043	979 aa		18.49	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	18.49	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	NUP93	Q8N1F7	819 aa		18.49	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	18.49	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	PHF21B	Q96EK2	531 aa		18.49	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	18.49	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	ADAM2	Q99965	735 aa		18.49	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		18.48	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		18.48	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	18.48	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	REP15	Q6BDI9	236 aa		18.48	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	C17orf99	Q6UX52	265 aa		18.48	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		18.48	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		18.48	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	18.48	■□□□□ 0.55	7e-8	■■■□□ 15
RRN3-205	ENST00000563559	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		18.48	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	GSTO2	Q9H4Y5	243 aa		18.48	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	AP4S1	Q9Y587	144 aa		18.48	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559		J3KR12	359 aa		18.47	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	WISP3	O95389	354 aa	Predicted RBP	18.47	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	S1PR4	O95977	384 aa		18.47	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	CLPTM1	O96005	669 aa		18.47	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	ITGB1	P05556	798 aa		18.47	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	MMP2	P08253	660 aa		18.47	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	TCN1	P20061	433 aa	Predicted RBP	18.47	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	GRIA2	P42262	883 aa		18.47	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	STX1B	P61266	288 aa		18.47	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	RHD	Q02161	417 aa		18.47	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	18.47	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	18.47	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		18.47	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	18.47	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	NAT14	Q8WUY8	206 aa		18.47	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		18.47	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	HDAC10	Q969S8	669 aa		18.47	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC167	Q9P0B6	97 aa		18.47	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	IGLV3-10	A0A075B6K4	115 aa		18.47	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559		E7ENX8	843 aa		18.47	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	TRIM24	O15164	1050 aa		18.47	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	INPPL1	O15357	1258 aa		18.47	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	PLK1	P53350	603 aa		18.47	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	MAX	P61244	160 aa		18.47	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	HERVK_113	P63132	956 aa		18.47	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		18.47	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF678	Q5SXM1	525 aa		18.47	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		18.47	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	ISCA2	Q86U28	154 aa		18.47	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	18.47	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	TADA1	Q96BN2	335 aa		18.47	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	18.47	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	C8orf48	Q96LL4	319 aa		18.47	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		18.47	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	ERVK-6	Q9BXR3	956 aa		18.47	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	18.47	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	18.47	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	ALG9	Q9H6U8	611 aa		18.47	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		18.47	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	RGS18	Q9NS28	235 aa		18.47	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	18.47	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		18.47	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		18.46	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		18.46	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	LOC285095	A0A1B0GVY8	99 aa		18.46	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	NRP2	O60462	931 aa		18.46	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	SUPT7L	O94864	414 aa		18.46	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	STAMBP	O95630	424 aa		18.46	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	18.46	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	DSC2	Q02487	901 aa		18.46	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	18.46	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		18.46	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		18.46	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	CLYBL	Q8N0X4	340 aa		18.46	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	TRPV1	Q8NER1	839 aa		18.46	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		18.46	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	EME1	Q96AY2	570 aa		18.46	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	ROPN1L	Q96C74	230 aa		18.46	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	18.46	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		18.46	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		18.46	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	UBAP1	Q9NZ09	502 aa		18.46	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	18.46	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	CROT	Q9UKG9	612 aa		18.46	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	18.46	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	FBP2	O00757	339 aa		18.46	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	MRAS	O14807	208 aa		18.46	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	18.46	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	OAZ2	O95190	189 aa		18.46	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	SMIM18	P0DKX4	95 aa		18.46	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	18.46	■□□□□ 0.55

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