RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562866.1

VPS9D1-AS1-202, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS9D1-AS1, Length 1,753 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 F8W8V4 182 aa21.42■■□□□ 1.02
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GJB3O75712 270 aa21.42■■□□□ 1.02
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GNAZP19086 355 aa21.41■■□□□ 1.02
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 EPHB3P54753 998 aa21.41■■□□□ 1.02
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FBXO27Q8NI29 283 aa21.41■■□□□ 1.02
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MAPK15Q8TD08 544 aa21.41■■□□□ 1.02
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MUC3BQ9H195 1237 aa21.41■■□□□ 1.02
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCL22O00626 93 aa21.41■■□□□ 1.02
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GRID2O43424 1007 aa21.41■■□□□ 1.02
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 OR51F1A6NGY5 319 aa21.4■■□□□ 1.02
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KLHL41O60662 606 aa21.4■■□□□ 1.02
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TWF1Q12792 350 aa21.4■■□□□ 1.02
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KLF10Q13118 480 aa21.4■■□□□ 1.02
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CYTH1Q15438 398 aa21.4■■□□□ 1.02
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MAN1C1Q9NR34 630 aa21.4■■□□□ 1.02
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 C2orf78A6NCI8 922 aa21.39■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TSPAN3O60637 253 aa21.39■■□□□ 1.01
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PMLP29590 882 aa21.39■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SGSHP51688 502 aa21.39■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CDKN2DP55273 166 aa21.39■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 AFTPHQ6ULP2 937 aa21.39■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ITIH5Q86UX2 942 aa21.39■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ADGRE3Q9BY15 652 aa21.39■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TMEM39AQ9NV64 488 aa21.39■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MCM8Q9UJA3 840 aa21.39■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
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