RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559586.5

RABGGTA-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 889 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-210ENST00000559586 IHHQ14623 411 aa20.19■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 LLGL1Q15334 1064 aa20.19■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 LRRC73Q5JTD7 316 aa20.19■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 SEL1L3Q68CR1 1132 aa20.19■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 FAM174AQ8TBP5 190 aa20.19■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 KIAA1524Q8TCG1 905 aa20.19■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 HCAR2Q8TDS4 363 aa20.19■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 RAB7BQ96AH8 199 aa20.19■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 HDAC11Q96DB2 347 aa20.19■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa20.19■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 MACROD2A1Z1Q3 448 aa20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 TK2O00142 265 aa20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 APOL1O14791 398 aa20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 ARHGAP6O43182 974 aa20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 MMP13P45452 471 aa20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 SCNN1BP51168 640 aa20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 RENBPP51606 427 aa20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 MAXP61244 160 aa20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 KIF5AQ12840 1032 aa20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF235Q14590 738 aa20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 GRM3Q14832 879 aa20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 MARC1Q5VT66 337 aa20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 NT5DC3Q86UY8 548 aa20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 RFX6Q8HWS3 928 aa20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 RCOR2Q8IZ40 523 aa20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 EXD1Q8NHP7 514 aa20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 ALG3Q92685 438 aa20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 KLK6Q92876 244 aa20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 LGMNQ99538 433 aa20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 HERPUD2Q9BSE4 406 aa20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 NOD2Q9HC29 1040 aa20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 CLCA2Q9UQC9 943 aa20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 HEY1Q9Y5J3 304 aa20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 PCDH8O95206 1070 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 PRLRP16471 622 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 MX2P20592 715 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 CTNNA2P26232 953 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 AKT2P31751 481 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 ACTN2P35609 894 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 AP1S1P61966 158 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 DYNLT1P63172 113 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 PROX2Q3B8N5 592 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 FAM182AQ5T1J6 154 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 ALG1LQ6GMV1 187 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 TTC7BQ86TV6 843 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 TMEM145Q8NBT3 493 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 CCDC112Q8NEF3 446 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 SPOCK2Q92563 424 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 FGF11Q92914 225 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 NUDCD1Q96RS6 583 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 NT5MQ9NPB1 228 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 EVA1BQ9NVM1 165 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 TSPAN6O43657 245 aa20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 CST8O60676 142 aa20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 THEGLP0DJG4 465 aa20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 ALPPL2P10696 532 aa20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 DAB2P98082 770 aa20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 PPP2R5EQ16537 467 aa20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 UGP2Q16851 508 aa20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 TFDP3Q5H9I0 405 aa20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 IFT43Q96FT9 208 aa20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 IL12RB2Q99665 862 aa20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 CA5BQ9Y2D0 317 aa20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 SLC31A1O15431 190 aa20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 SIGLEC6O43699 453 aa20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 CCNB1P14635 433 aa20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 SERPINA4P29622 427 aa20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 CLDN6P56747 220 aa20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 RPS21P63220 83 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 BRAT1Q6PJG6 821 aa20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 CCDC13Q8IYE1 715 aa20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 CNTD1Q8N815 330 aa20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 OR4C6Q8NH72 309 aa20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 NSMCE1Q8WV22 266 aa20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms