RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557076.5

SCFD1-223, Transcript of sec1 family domain containing 1, human

TSL 3

Gene SCFD1, Length 743 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCFD1-223	ENST00000557076	TNFRSF8	P28908	595 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	SLC5A2	P31639	672 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	PRPH	P41219	470 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	SLC5A3	P53794	718 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	STAT4	Q14765	748 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	IL17A	Q16552	155 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	TTC38	Q5R3I4	469 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	CACUL1	Q86Y37	369 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	CPXM2	Q8N436	756 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	WDR48	Q8TAF3	677 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	MAPK15	Q8TD08	544 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	MIB2	Q96AX9	1013 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	NUDT11	Q96G61	164 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	C1orf159	Q96HA4	380 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	OMD	Q99983	421 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	STRA6	Q9BX79	667 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	INTS13	Q9NVM9	706 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	SCML2	Q9UQR0	700 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	DMTF1	Q9Y222	760 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	NME7	Q9Y5B8	376 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076		U3KQA8	63 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	NF1	P21359	2839 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	OBSL1	O75147	1896 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	HIVEP1	P15822	2718 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	SLC12A8	A0AV02	714 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	PP2D1	A8MPX8	630 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	TISP43	B9A030	160 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	AGRP	O00253	132 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	PLD2	O14939	933 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	MID1	O15344	667 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	SLC26A4	O43511	780 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	DTNB	O60941	627 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	SDC3	O75056	442 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	FBXO21	O94952	628 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	REC8	O95072	547 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	RARG	P13631	454 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	HLA-F	P30511	346 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	SLC8A1	P32418	973 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	MAP4K2	Q12851	820 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	TGIF1	Q15583	401 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	CST6	Q15828	149 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	FXN	Q16595	210 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	HNRNPA1L2	Q32P51	320 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	MPPE1	Q53F39	396 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	MANEA	Q5SRI9	462 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	C9orf64	Q5T6V5	341 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	FHL5	Q5TD97	284 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	KDM1B	Q8NB78	822 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	OR14C36	Q8NHC7	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	IFI44	Q8TCB0	444 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	DDI1	Q8WTU0	396 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	HVCN1	Q96D96	273 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	AJUBA	Q96IF1	538 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	REEP2	Q9BRK0	252 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	GPR27	Q9NS67	375 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	OSER1	Q9NX31	292 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63

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