RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551157.6

TARBP2-216, Transcript of TARBP2, RISC loading complex RNA binding subunit, human

TSL 3

Gene TARBP2, Length 1,008 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARBP2-216	ENST00000551157	GPR34	Q9UPC5	381 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TARBP2-216	ENST00000551157	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TARBP2-216	ENST00000551157	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TARBP2-216	ENST00000551157	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TARBP2-216	ENST00000551157	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TARBP2-216	ENST00000551157		K7ENP7	123 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TARBP2-216	ENST00000551157	ERVH48-1	M5A8F1	160 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TARBP2-216	ENST00000551157	PEX11B	O96011	259 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TARBP2-216	ENST00000551157	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TARBP2-216	ENST00000551157	TNFAIP3	P21580	790 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TARBP2-216	ENST00000551157	IL1R2	P27930	398 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TARBP2-216	ENST00000551157	UGT1A5	P35504	534 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TARBP2-216	ENST00000551157	MYL5	Q02045	173 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TARBP2-216	ENST00000551157	VAC14	Q08AM6	782 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TARBP2-216	ENST00000551157	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TARBP2-216	ENST00000551157	SPIDR	Q14159	915 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TARBP2-216	ENST00000551157	AGER	Q15109	404 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TARBP2-216	ENST00000551157	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TARBP2-216	ENST00000551157	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TARBP2-216	ENST00000551157	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TARBP2-216	ENST00000551157	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TARBP2-216	ENST00000551157	NRROS	Q86YC3	692 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TARBP2-216	ENST00000551157	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TARBP2-216	ENST00000551157	LSMEM2	Q8N112	164 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TARBP2-216	ENST00000551157	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TARBP2-216	ENST00000551157	ARL10	Q8N8L6	244 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TARBP2-216	ENST00000551157		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TARBP2-216	ENST00000551157	GPR156	Q8NFN8	814 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TARBP2-216	ENST00000551157	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TARBP2-216	ENST00000551157	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TARBP2-216	ENST00000551157	PMEPA1	Q969W9	287 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TARBP2-216	ENST00000551157	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TARBP2-216	ENST00000551157	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	13.53	□□□□□ -0.24
TARBP2-216	ENST00000551157	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TARBP2-216	ENST00000551157	KL	Q9UEF7	1012 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TARBP2-216	ENST00000551157	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TARBP2-216	ENST00000551157	SDK2	Q58EX2	2172 aa		13.52	□□□□□ -0.24
TARBP2-216	ENST00000551157	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	LRRC53	A6NM62	1247 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157		D6RAR5	112 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	13.52	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	TCEA3	O75764	348 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	RASGRP1	O95267	797 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	LHCGR	P22888	699 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	PSMA2	P25787	234 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	RBMS1	P29558	406 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	MIP	P30301	263 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	SLC5A2	P31639	672 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	PEX5	P50542	639 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	NDST2	P52849	883 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	RAD51	Q06609	339 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	ELP6	Q0PNE2	266 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	RFX8	Q6ZV50	586 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	EXD3	Q8N9H8	876 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	WDR36	Q8NI36	951 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	PATE1	Q8WXA2	126 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	WDR92	Q96MX6	357 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	CATSPERB	Q9H7T0	1116 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157		B4DGG1	531 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	DFFA	O00273	331 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	FGF10	O15520	208 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	LRCH4	O75427	683 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	PALM	O75781	387 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	CTSE	P14091	401 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	ARSD	P51689	593 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	MAZ	P56270	477 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	MTM1	Q13496	603 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	DPYS	Q14117	519 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	STX1A	Q16623	288 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	LINC00303	Q3SY05	128 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	ZNF605	Q86T29	641 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	LSM14A	Q8ND56	463 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	NAT6	Q93015	286 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	DPH1	Q9BZG8	443 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	LRRN3	Q9H3W5	708 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	PLD2	O14939	933 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	B4GAT1	O43505	415 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	ITGA2B	P08514	1039 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	SKIL	P12757	684 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TARBP2-216	ENST00000551157	CR2	P20023	1033 aa		13.5	□□□□□ -0.25

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