RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-223ENST00000551137 MAML1Q92585 1016 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 APOLD1Q96LR9 279 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 CCDC42Q96M95 316 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 CHP1Q99653 195 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 DEF6Q9H4E7 631 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 KCTD5Q9NXV2 234 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 SPASTQ9UBP0 616 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 U3KQA8 63 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 ITPR1Q14643 2758 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 TRABD2BA6NFA1 517 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 LMO7DNF2Z398 122 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 MATN3O15232 486 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 AQP9O43315 295 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 CCNCP24863 283 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 NFKBIAP25963 317 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 BLKP51451 505 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 ADKP55263 362 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 NFATC4Q14934 902 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 LVRNQ6Q4G3 990 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 RHOT2Q8IXI1 618 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 PHACTR4Q8IZ21 702 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 PQLC3Q8N755 202 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 KCTD6Q8NC69 237 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 RNF214Q8ND24 703 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 ATL2Q8NHH9 583 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 APOOQ9BUR5 198 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 BOCQ9BWV1 1114 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 NOD2Q9HC29 1040 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 EVA1BQ9NVM1 165 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 PHTF1Q9UMS5 762 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 DGKBQ9Y6T7 804 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 PSMD11O00231 422 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 FFAR2O15552 330 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 MFSD11O43934 449 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 FZD6O60353 706 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 GCATO75600 419 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 LCA5LO95447 670 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 JUPP14923 745 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 GM2AP17900 193 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 MX2P20592 715 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 KDELR1P24390 212 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 HTR1BP28222 390 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 SSR1P43307 286 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 HK3P52790 923 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 HADHBP55084 474 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 PPARDQ03181 441 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 INPP5AQ14642 412 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 RTP5Q14D33 572 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 HES3Q5TGS1 186 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 CDCP2Q5VXM1 449 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 CPNE8Q86YQ8 564 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 SCRN2Q96FV2 425 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 COQ10AQ96MF6 247 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 RNF157Q96PX1 679 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 LRRC61Q9BV99 259 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 SLC13A1Q9BZW2 595 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 NRSN2Q9GZP1 204 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 CAAP1Q9H8G2 361 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 SCUBE2Q9NQ36 999 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 B4GALT6Q9UBX8 382 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 COQ6Q9Y2Z9 468 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 SHROOM3Q8TF72 1996 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 NBEAQ8NFP9 2946 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 MYLKQ15746 1914 aa11.52□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
CS-223ENST00000551137 FAM149AA5PLN7 773 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-223ENST00000551137 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
CS-223ENST00000551137 TNFRSF10CO14798 259 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-223ENST00000551137 OPA1O60313 960 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-223ENST00000551137 NEBLO76041 1014 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-223ENST00000551137 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
CS-223ENST00000551137 PGLSO95336 258 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-223ENST00000551137 ELFN1P0C7U0 828 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-223ENST00000551137 TEAD1P28347 426 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-223ENST00000551137 SLC1A1P43005 524 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-223ENST00000551137 KIAA1024LP59773 190 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-223ENST00000551137 DAB2P98082 770 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-223ENST00000551137 TRAF2Q12933 501 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-223ENST00000551137 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP11.52□□□□□ -0.57
CS-223ENST00000551137 ELOCQ15369 112 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-223ENST00000551137 ALG11Q2TAA5 492 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-223ENST00000551137 CCDC157Q569K6 752 aa11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75 ms