RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550442.5

LETMD1-223, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 4

Gene LETMD1, Length 469 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-223	ENST00000550442	TOP1MT	Q969P6	601 aa		11.89	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	FICD	Q9BVA6	458 aa		11.89	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	CEP41	Q9BYV8	373 aa		11.89	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	TASP1	Q9H6P5	420 aa		11.89	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	CWH43	Q9H720	699 aa		11.89	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		11.89	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	INTS10	Q9NVR2	710 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		11.89	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		11.89	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	PRPF19	Q9UMS4	504 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		11.89	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF292	O60281	2723 aa		11.89	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	MTMR11	A4FU01	709 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	ITGB1	P05556	798 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	PCSK2	P16519	638 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	OR1E1	P30953	314 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	BMPR1A	P36894	532 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	IDH3A	P50213	366 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	CLCN2	P51788	898 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	TAF10	Q12962	218 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	ITGA9	Q13797	1035 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	MBTPS1	Q14703	1052 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	MAPRE2	Q15555	327 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	ARTN	Q5T4W7	220 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	FBXL22	Q6P050	247 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	IFT43	Q96FT9	208 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	TMEM209	Q96SK2	561 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	AGAP2	Q99490	1192 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	RTKN	Q9BST9	563 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	MECR	Q9BV79	373 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	SYTL2	Q9HCH5	934 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	GMIP	Q9P107	970 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	MTRR	Q9UBK8	725 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	VPS28	Q9UK41	221 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	RGSL1	A5PLK6	1076 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	TARM1	B6A8C7	271 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	ACSL4	O60488	711 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	TLR5	O60602	858 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	USP12	O75317	370 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	EFEMP2	O95967	443 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	GALT	P07902	379 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC35E2B	P0CK96	405 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	TPBGL	P0DKB5	382 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	AP2B1	P63010	937 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	PRAME	P78395	509 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	XIAP	P98170	497 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	NFKB2	Q00653	900 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	EFEMP1	Q12805	493 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	CDC16	Q13042	620 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	PLD1	Q13393	1074 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF235	Q14590	738 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	GRM3	Q14832	879 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	CNGA3	Q16281	694 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	DDR2	Q16832	855 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	HECTD3	Q5T447	861 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	LRRC8E	Q6NSJ5	796 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	RTL10	Q7L3V2	364 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	TMEM126B	Q8IUX1	230 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	EFHB	Q8N7U6	833 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	RHEBL1	Q8TAI7	183 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	HASPIN	Q8TF76	798 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	PSKH2	Q96QS6	385 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	SORT1	Q99523	831 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	CCT7	Q99832	543 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	CD248	Q9HCU0	757 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		11.87	□□□□□ -0.51

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