RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547298.5

CS-208, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-208ENST00000547298 TMEM71Q6P5X7 295 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 GDPD4Q6W3E5 623 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 ZNF783Q6ZMS7 281 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 TP53INP2Q8IXH6 220 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 NAGSQ8N159 534 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 ESX1Q8N693 406 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 OR2AP1Q8NGE2 309 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 ATL2Q8NHH9 583 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 KIAA1524Q8TCG1 905 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 C19orf60Q96EN9 201 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 RNF31Q96EP0 1072 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 C5orf34Q96MH7 638 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 MED15Q96RN5 788 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 RANBP9Q96S59 729 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 ZPBPQ9BS86 351 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 LGR4Q9BXB1 951 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 TKTL2Q9H0I9 626 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 ATP13A1Q9HD20 1204 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 PIGVQ9NUD9 493 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 LUZP4Q9P127 313 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 CROTQ9UKG9 612 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 CROCCQ5TZA2 2017 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 TNFRSF10CO14798 259 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 STX10O60499 249 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 GRAP2O75791 330 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 GSRP00390 522 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 CCNB1P14635 433 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 ZNF28P17035 718 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 DLSTP36957 453 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 ACVRL1P37023 503 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 GNA12Q03113 381 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 MTA1Q13330 715 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 CUL4AQ13619 759 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 CEACAM20Q6UY09 585 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 MCEMP1Q8IX19 187 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 PELI3Q8N2H9 469 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 WDTC1Q8N5D0 677 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 LMO3Q8TAP4 145 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 ASNSD1Q9NWL6 643 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 TAAR2Q9P1P5 351 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 CDC14CA4D256 554 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 A8MU76 341 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 KRT86O43790 486 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 MAP3K6O95382 1288 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 GLI1P08151 1106 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 GM2AP17900 193 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 AK4P27144 223 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 TRIM23P36406 574 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 CXCR3P49682 368 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 PDCLQ13371 301 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 NR6A1Q15406 480 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 TESK1Q15569 626 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 RESP18Q5W5W9 173 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 CPZQ66K79 652 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 C1orf74Q96LT6 269 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 DPYSL5Q9BPU6 564 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 NDFIP2Q9NV92 336 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 CNTN6Q9UQ52 1028 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 MED13LQ71F56 2210 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 PRSS38A1L453 326 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 RHOBTB3O94955 611 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 YEATS4O95619 227 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 RECKO95980 971 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 STAT1P42224 750 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 LIG3P49916 1009 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 PGDP52209 483 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 EFHC1Q5JVL4 640 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 TCERG1LQ5VWI1 586 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 LEKR1Q6ZMV7 388 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 ARHGEF19Q8IW93 802 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 CEP57L1Q8IYX8 460 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 NETO2Q8NC67 525 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 SLC35C1Q96A29 364 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 CPXM1Q96SM3 734 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 NPY6RQ99463 290 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 SLC29A3Q9BZD2 475 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 WDCPQ9H6R7 721 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 PCDH12Q9NPG4 1184 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 ACP6Q9NPH0 428 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms