RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545170.5

ATXN3-216, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ATXN3, Length 6,950 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-216ENST00000545170 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
ATXN3-216ENST00000545170 PEX6Q13608 980 aa8.65□□□□□ -1.02
ATXN3-216ENST00000545170 COMTD1Q86VU5 262 aa8.65□□□□□ -1.02
ATXN3-216ENST00000545170 KIF18BQ86Y91 864 aa8.65□□□□□ -1.02
ATXN3-216ENST00000545170 SERAC1Q96JX3 654 aa8.65□□□□□ -1.02
ATXN3-216ENST00000545170 TTYH2Q9BSA4 534 aa8.65□□□□□ -1.02
ATXN3-216ENST00000545170 ALG9Q9H6U8 611 aa8.65□□□□□ -1.02
ATXN3-216ENST00000545170 CYP3A43Q9HB55 503 aa8.65□□□□□ -1.02
ATXN3-216ENST00000545170 MTMR10Q9NXD2 777 aa8.65□□□□□ -1.02
ATXN3-216ENST00000545170 SNTG2Q9NY99 539 aa8.65□□□□□ -1.02
ATXN3-216ENST00000545170 GMIPQ9P107 970 aa8.65□□□□□ -1.02
ATXN3-216ENST00000545170 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa8.65□□□□□ -1.02
ATXN3-216ENST00000545170 CORO2BQ9UQ03 480 aa8.65□□□□□ -1.02
ATXN3-216ENST00000545170 LINC00032P0C843 101 aa8.65□□□□□ -1.02
ATXN3-216ENST00000545170 GADD45AP24522 165 aa8.65□□□□□ -1.02
ATXN3-216ENST00000545170 CACNB3P54284 484 aa8.65□□□□□ -1.02
ATXN3-216ENST00000545170 AP1S1P61966 158 aa8.65□□□□□ -1.02
ATXN3-216ENST00000545170 DPYSL3Q14195 570 aa8.65□□□□□ -1.02
ATXN3-216ENST00000545170 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
ATXN3-216ENST00000545170 QRICH1Q2TAL8 776 aa8.65□□□□□ -1.02
ATXN3-216ENST00000545170 PCID2Q5JVF3 399 aa8.65□□□□□ -1.02
ATXN3-216ENST00000545170 ZNF470Q6ECI4 717 aa8.65□□□□□ -1.02
ATXN3-216ENST00000545170 FAM171BQ6P995 826 aa8.65□□□□□ -1.02
ATXN3-216ENST00000545170 POTEHQ6S545 545 aa8.65□□□□□ -1.02
ATXN3-216ENST00000545170 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa8.65□□□□□ -1.02
ATXN3-216ENST00000545170 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
ATXN3-216ENST00000545170 ANKRA2Q9H9E1 313 aa8.65□□□□□ -1.02
ATXN3-216ENST00000545170 KCND2Q9NZV8 630 aa8.65□□□□□ -1.02
ATXN3-216ENST00000545170 ZNF639Q9UID6 485 aa8.65□□□□□ -1.02
ATXN3-216ENST00000545170 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
ATXN3-216ENST00000545170 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa8.65□□□□□ -1.02
ATXN3-216ENST00000545170 CYBBP04839 570 aa8.65□□□□□ -1.02
ATXN3-216ENST00000545170 SLC2A3P11169 496 aa8.65□□□□□ -1.02
ATXN3-216ENST00000545170 CD36P16671 472 aa8.65□□□□□ -1.02
ATXN3-216ENST00000545170 TSPAN8P19075 237 aa8.65□□□□□ -1.02
ATXN3-216ENST00000545170 ECHS1P30084 290 aa8.65□□□□□ -1.02
ATXN3-216ENST00000545170 RBM34P42696 430 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
ATXN3-216ENST00000545170 ABCG1P45844 678 aa8.65□□□□□ -1.02
ATXN3-216ENST00000545170 GABRB2P47870 512 aa8.65□□□□□ -1.02
ATXN3-216ENST00000545170 FSTL1Q12841 308 aa8.65□□□□□ -1.02
ATXN3-216ENST00000545170 PFKFB4Q16877 469 aa8.65□□□□□ -1.02
ATXN3-216ENST00000545170 REP15Q6BDI9 236 aa8.65□□□□□ -1.02
ATXN3-216ENST00000545170 LPGAT1Q92604 370 aa8.65□□□□□ -1.02
ATXN3-216ENST00000545170 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa8.65□□□□□ -1.02
ATXN3-216ENST00000545170 FEM1BQ9UK73 627 aa8.65□□□□□ -1.02
ATXN3-216ENST00000545170 ZNF232Q9UNY5 417 aa8.65□□□□□ -1.02
ATXN3-216ENST00000545170 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa8.65□□□□□ -1.02
ATXN3-216ENST00000545170 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa8.65□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 IPO13O94829 963 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 IL18RAPO95256 599 aa8.65□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 FTH1P02794 183 aa8.65□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 FMO3P31513 532 aa8.65□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 NUMBP49757 651 aa8.65□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 EMC2Q15006 297 aa8.65□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 ANKDD1AQ495B1 522 aa8.65□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 WDR59Q6PJI9 974 aa8.65□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 TMEM179Q6ZVK1 233 aa8.65□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa8.65□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 ASB15Q8WXK1 588 aa8.65□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 TCEAL4Q96EI5 215 aa8.65□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 FNDC11Q9BVV2 318 aa8.65□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 ZNF341Q9BYN7 854 aa8.65□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 GDAP2Q9NXN4 497 aa8.65□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 VPS51Q9UID3 782 aa8.65□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 RAB23Q9ULC3 237 aa8.65□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 TNRQ92752 1358 aa8.65□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 ADGRL2O95490 1459 aa8.65□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 SMIM22K7EJ46 135 aa8.65□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 OIP5O43482 229 aa8.65□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 SLC15A1P46059 708 aa8.65□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 NAGLUP54802 743 aa8.65□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 SMIM11AP58511 58 aa8.65□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 PRKCEQ02156 737 aa8.65□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 LIPEQ05469 1076 aa8.65□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 BRMS1LQ5PSV4 323 aa8.65□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 RIOX2Q8IUF8 465 aa8.65□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 SLC44A5Q8NCS7 719 aa8.65□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 MGME1Q9BQP7 344 aa8.65□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 NLNQ9BYT8 704 aa8.65□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 MAGEB3O15480 346 aa8.64□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 GH1P01241 217 aa8.64□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 APOC3P02656 99 aa8.64□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 TSPAN5P62079 268 aa8.64□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 KLF10Q13118 480 aa8.64□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 PPIL2Q13356 520 aa8.64□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 TLR1Q15399 786 aa8.64□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 KRBOX4Q5JUW0 171 aa8.64□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 LIPMQ5VYY2 423 aa8.64□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa8.64□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 TBL1YQ9BQ87 522 aa8.64□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 AHSPQ9NZD4 102 aa8.64□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 PCYOX1Q9UHG3 505 aa8.64□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms