RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538258.1

PGA3-204, Transcript of pepsinogen 3, group I (pepsinogen A), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PGA3, Length 867 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3-204ENST00000538258 NFKBIAP25963 317 aa9.13□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 PTPN3P26045 913 aa9.13□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 MMP12P39900 470 aa9.13□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 CD86P42081 329 aa9.13□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 LIMK1P53667 647 aa9.13□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 BNC1Q01954 994 aa9.13□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 SEMG2Q02383 582 aa9.13□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 NIPAL4Q0D2K0 466 aa9.13□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 XRCC4Q13426 336 aa9.13□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 FGL2Q14314 439 aa9.13□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 STAT4Q14765 748 aa9.13□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 NOMO1Q15155 1222 aa9.13□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 RPS6KA1Q15418 735 aa9.13□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 KIF19Q2TAC6 998 aa9.13□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 UAP1L1Q3KQV9 507 aa9.13□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 TMEM52BQ4KMG9 183 aa9.13□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 TEX44Q53QW1 395 aa9.13□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 FAM182AQ5T1J6 154 aa9.13□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 SEL1L2Q5TEA6 688 aa9.13□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 MEI1Q5TIA1 1274 aa9.13□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 IL27RAQ6UWB1 636 aa9.13□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 MINDY1Q8N5J2 469 aa9.13□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 CNTD1Q8N815 330 aa9.13□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 MFSD2AQ8NA29 543 aa9.13□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 TRIM58Q8NG06 486 aa9.13□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 OR2I1PQ8NGU4 316 aa9.13□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 ARRDC2Q8TBH0 407 aa9.13□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 ACTL9Q8TC94 416 aa9.13□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 FERMT1Q9BQL6 677 aa9.13□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa9.13□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 FZD3Q9NPG1 666 aa9.13□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 CA5BQ9Y2D0 317 aa9.13□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa9.13□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 RAI2Q9Y5P3 530 aa9.13□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 SNX11Q9Y5W9 270 aa9.13□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 ACACBO00763 2458 aa9.13□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 FRYLO94915 3013 aa9.13□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 A8MX80 341 aa9.12□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 SLC30A4O14863 429 aa9.12□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 RAD51BO15315 384 aa9.12□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 ZSCAN12O43309 604 aa9.12□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 OPHN1O60890 802 aa9.12□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 CER1O95813 267 aa9.12□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 C6P13671 934 aa9.12□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 LIG3P49916 1009 aa9.12□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 EPHB1P54762 984 aa9.12□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 CLDN2P57739 230 aa9.12□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 SKOR1P84550 965 aa9.12□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 WASHC5Q12768 1159 aa9.12□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 IHHQ14623 411 aa9.12□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 HLA-BQ31612 363 aa9.12□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 DPPA4Q7L190 304 aa9.12□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 IQCHQ86VS3 1027 aa9.12□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 NDUFAF2Q8N183 169 aa9.12□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 TTC13Q8NBP0 860 aa9.12□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 TMEM145Q8NBT3 493 aa9.12□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 HTR3CQ8WXA8 447 aa9.12□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 ASB12Q8WXK4 309 aa9.12□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 SPOCK2Q92563 424 aa9.12□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 COL26A1Q96A83 441 aa9.12□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 KLHDC7BQ96G42 594 aa9.12□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 TEKT5Q96M29 485 aa9.12□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP9.12□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 FAM118BQ9BPY3 351 aa9.12□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 SLC25A51Q9H1U9 297 aa9.12□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 GAREM1Q9H706 876 aa9.12□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 C10orf88Q9H8K7 445 aa9.12□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 GLOD4Q9HC38 313 aa9.12□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 B4GALT6Q9UBX8 382 aa9.12□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 PHTF1Q9UMS5 762 aa9.12□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 CHKBQ9Y259 395 aa9.12□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 COQ6Q9Y2Z9 468 aa9.12□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 A6NNZ2 444 aa9.11□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 H0Y8X5 98 aa9.11□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 TLR4O00206 839 aa9.11□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 KCNK3O14649 394 aa9.11□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 FPGTO14772 594 aa9.11□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 FZD6O60353 706 aa9.11□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 MAGEC1O60732 1142 aa9.11□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 STK10O94804 968 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 MMP2P08253 660 aa9.11□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 PDHA1P08559 390 aa9.11□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 ELFN1P0C7U0 828 aa9.11□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 THEGLP0DJG4 465 aa9.11□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 RBP3P10745 1247 aa9.11□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 CTPS1P17812 591 aa9.11□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 NFKB1P19838 968 aa9.11□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 RBL1P28749 1068 aa9.11□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 VIPR1P32241 457 aa9.11□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 CTSKP43235 329 aa9.11□□□□□ -0.95
PGA3-204ENST00000538258 NXPH1P58417 271 aa9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms