RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534106.2

CHMP4A-208, Transcript of charged multivesicular body protein 4A, humanhuman

TSL 5

Gene CHMP4A, Length 370 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4A-208ENST00000534106 E2F1Q01094 437 aa3.1□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 CD83Q01151 205 aa3.1□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 GUCY1B3Q02153 619 aa3.1□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 ENPP2Q13822 863 aa3.1□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
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CHMP4A-208ENST00000534106 LONRF2Q1L5Z9 754 aa3.1□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 ISXQ2M1V0 245 aa3.1□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 INAVAQ3KP66 663 aa3.1□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 CFAP221Q4G0U5 840 aa3.1□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 HECTD3Q5T447 861 aa3.1□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 SFMBT2Q5VUG0 894 aa3.1□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 KIAA0895LQ68EN5 471 aa3.1□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 NCEH1Q6PIU2 408 aa3.1□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 HTR3DQ70Z44 454 aa3.1□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 ZFAND4Q86XD8 727 aa3.1□□□□□ -1.91
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CHMP4A-208ENST00000534106 GPR135Q8IZ08 494 aa3.1□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 LSMEM2Q8N112 164 aa3.1□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa3.1□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa3.1□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 NECAB1Q8N987 351 aa3.1□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 HIPK4Q8NE63 616 aa3.1□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 OR2T3Q8NH03 318 aa3.1□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa3.1□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 CFHR4Q92496 578 aa3.1□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 FBXO32Q969P5 355 aa3.1□□□□□ -1.91
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CHMP4A-208ENST00000534106 PCED1BQ96HM7 432 aa3.1□□□□□ -1.91
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CHMP4A-208ENST00000534106 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 MMS19Q96T76 1030 aa3.1□□□□□ -1.91
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CHMP4A-208ENST00000534106 SYT15Q9BQS2 421 aa3.1□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 TTLL2Q9BWV7 592 aa3.1□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 BTBD2Q9BX70 525 aa3.1□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 B3GNT5Q9BYG0 378 aa3.1□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 AGXT2Q9BYV1 514 aa3.1□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 CIPCQ9C0C6 399 aa3.1□□□□□ -1.91
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CHMP4A-208ENST00000534106 SLC25A18Q9H1K4 315 aa3.1□□□□□ -1.91
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CHMP4A-208ENST00000534106 THSD1Q9NS62 852 aa3.1□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 OSER1Q9NX31 292 aa3.1□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 ELOVL2Q9NXB9 296 aa3.1□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 WDR35Q9P2L0 1181 aa3.1□□□□□ -1.91
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CHMP4A-208ENST00000534106 U3KQA8 63 aa3.1□□□□□ -1.91
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CHMP4A-208ENST00000534106 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
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CHMP4A-208ENST00000534106 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 CDRT15L2A8MXV6 281 aa3.09□□□□□ -1.91
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CHMP4A-208ENST00000534106 DFNA5O60443 496 aa3.09□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 JAK2O60674 1132 aa3.09□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 BEST1O76090 585 aa3.09□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 AGFG2O95081 481 aa3.09□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 CLDN1O95832 211 aa3.09□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 PEX11BO96011 259 aa3.09□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 KRT19P08727 400 aa3.09□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 OR52Z1P0C646 297 aa3.09□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 CDK4P11802 303 aa3.09□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 PRF1P14222 555 aa3.09□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 GNLYP22749 145 aa3.09□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 DGKAP23743 735 aa3.09□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 ANXA13P27216 316 aa3.09□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 YWHAQP27348 245 aa3.09□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 CD38P28907 300 aa3.09□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 SLC5A2P31639 672 aa3.09□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 DEKP35659 375 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
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CHMP4A-208ENST00000534106 TRAPPC10P48553 1259 aa3.09□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 MYL7Q01449 175 aa3.09□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 ILKQ13418 452 aa3.09□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 RIN1Q13671 783 aa3.09□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 KRT32Q14532 448 aa3.09□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 CDKN3Q16667 212 aa3.09□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 ADALQ6DHV7 355 aa3.09□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa3.09□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 PAQR9Q6ZVX9 377 aa3.09□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP3.09□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 CD302Q8IX05 232 aa3.09□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 NUP93Q8N1F7 819 aa3.09□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 MYCT1Q8N699 235 aa3.09□□□□□ -1.91
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