RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C5AR1P21730 350 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ITGB7P26010 798 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NMBRP28336 390 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SSTR1P30872 391 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HSD17B3P37058 310 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RPS14P62263 151 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMPRSS15P98073 1019 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SATB1Q01826 763 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CCDC15Q0P6D6 951 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CBLBQ13191 982 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC29A2Q14542 456 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CST6Q15828 149 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 UGP2Q16851 508 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TJAP1Q5JTD0 557 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LRRC73Q5JTD7 316 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPANXN3Q5MJ09 141 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 UNC5AQ6ZN44 842 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 Q6ZS52 159 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRIM67Q6ZTA4 783 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NLRP9Q7RTR0 991 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HDXQ7Z353 690 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMPRSS6Q8IU80 811 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RELL1Q8IUW5 271 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PGBD3Q8N328 593 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HDDC3Q8N4P3 179 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ANKRD7Q92527 254 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 VOPP1Q96AW1 172 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SCRN2Q96FV2 425 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RANBP9Q96S59 729 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OMDQ99983 421 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRABDQ9H4I3 376 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FBRSQ9HAH7 460 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MAGEE1Q9HCI5 957 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PCDH12Q9NPG4 1184 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MMP17Q9ULZ9 603 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SOX13Q9UN79 622 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TCAF1Q9Y4C2 921 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KCTD3Q9Y597 815 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ARL5AQ9Y689 179 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DOCK8Q8NF50 2099 aa8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A0A0U1RQS6 177 aa8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TSPAN11A1L157 253 aa8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CAPN8A6NHC0 703 aa8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GOLGA8CPA6NN73 597 aa8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AURKAO14965 403 aa8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RIPK2O43353 540 aa8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPAG6O75602 509 aa8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CLDN7O95471 211 aa8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GSTA2P09210 222 aa8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ACADMP11310 421 aa8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PAMP19021 973 aa8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LPOP22079 712 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 VIPR1P32241 457 aa8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SUOXP51687 545 aa8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NEK3P51956 506 aa8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 METAP1P53582 386 aa8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 COPAP53621 1224 aa8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GPX6P59796 221 aa8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PDE1BQ01064 536 aa8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IFFO1Q0D2I5 559 aa8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CNTN1Q12860 1018 aa8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ARHGEF7Q14155 803 aa8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PTPRCAPQ14761 206 aa8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CASP8Q14790 479 aa8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SKIDA1Q1XH10 827 aa8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TSTD2Q5T7W7 516 aa8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CRTC1Q6UUV9 634 aa8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM92Q6UXU6 159 aa8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TSPAN33Q86UF1 283 aa8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF687Q8N1G0 1237 aa8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MREGQ8N565 214 aa8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MDGA1Q8NFP4 955 aa8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
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