RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 CTBP1Q13363 440 aa7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 PPM1JQ5JR12 505 aa7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 RTP2Q5QGT7 225 aa7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 C16orf59Q7L2K0 433 aa7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 BEND5Q7L4P6 421 aa7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 OTOP2Q7RTS6 562 aa7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 OTOAQ7RTW8 1153 aa7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 PIGWQ7Z7B1 504 aa7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 GALNT7Q86SF2 657 aa7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 AUTS2Q8WXX7 1259 aa7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 HDAC11Q96DB2 347 aa7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 VPS39Q96JC1 886 aa7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 TBL1YQ9BQ87 522 aa7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 CAB39LQ9H9S4 337 aa7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 NMRK1Q9NWW6 199 aa7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 HEY2Q9UBP5 337 aa7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 MGAMO43451 1857 aa7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 A0A096LPK6 155 aa7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 SYCE1LA8MT33 242 aa7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 MUSKO15146 869 aa7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 CHEK2O96017 543 aa7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 GNRH1P01148 92 aa7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 GALTP07902 379 aa7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 MYL2P10916 166 aa7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 MLNP12872 115 aa7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 NAGAP17050 411 aa7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 TRIM60Q495X7 471 aa7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 SPANXN3Q5MJ09 141 aa7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF470Q6ECI4 717 aa7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 TMC7Q7Z402 723 aa7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 ITIH5Q86UX2 942 aa7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 TNS4Q8IZW8 715 aa7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 CADM3Q8N126 398 aa7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 ELMO2Q96JJ3 720 aa7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 BTN2A3PQ96KV6 586 aa7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 FERD3LQ96RJ6 166 aa7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 AGAP2Q99490 1192 aa7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 SMOC2Q9H3U7 446 aa7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 PALMDQ9NP74 551 aa7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 HAO1Q9UJM8 370 aa7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 HS3ST4Q9Y661 456 aa7.9□□□□□ -1.14
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TRPS1-208ENST00000519076 ZNF487B1APH4 448 aa7.9□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 PFDN6O15212 129 aa7.9□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 PEX11AO75192 247 aa7.9□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 GLRA3O75311 464 aa7.9□□□□□ -1.15
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TRPS1-208ENST00000519076 CCL5P13501 91 aa7.9□□□□□ -1.15
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TRPS1-208ENST00000519076 GCAP28676 217 aa7.9□□□□□ -1.15
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TRPS1-208ENST00000519076 NPY2RP49146 381 aa7.9□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 PGFP49763 221 aa7.9□□□□□ -1.15
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TRPS1-208ENST00000519076 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 PM20D1Q6GTS8 502 aa7.9□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 SCD5Q86SK9 330 aa7.9□□□□□ -1.15
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TRPS1-208ENST00000519076 HERVK_113Q902F9 699 aa7.9□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 PSMG2Q969U7 264 aa7.9□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 DCLRE1BQ9H816 532 aa7.9□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 SCPEP1Q9HB40 452 aa7.9□□□□□ -1.15
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TRPS1-208ENST00000519076 IGSF9Q9P2J2 1179 aa7.9□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 LZTS1Q9Y250 596 aa7.9□□□□□ -1.15
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TRPS1-208ENST00000519076 OAZ2O95190 189 aa7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 AMHP03971 560 aa7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 S100A6P06703 90 aa7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 ACRP10323 421 aa7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 CFL1P23528 166 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 CNTFP26441 200 aa7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 CPA2P48052 419 aa7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 WNT3AP56704 352 aa7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 BST1Q10588 318 aa7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 UGP2Q16851 508 aa7.89□□□□□ -1.15
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