RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516661.1

RNU6-551P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 551, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-551P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-551P-201ENST00000516661 THPOP40225 353 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-551P-201ENST00000516661 PRAMEP78395 509 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-551P-201ENST00000516661 ADORA2A-AS1P86434 159 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-551P-201ENST00000516661 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-551P-201ENST00000516661 COL28A1Q2UY09 1125 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-551P-201ENST00000516661 ZNF284Q2VY69 593 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-551P-201ENST00000516661 ODF3L2Q3SX64 289 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-551P-201ENST00000516661 SGO1Q5FBB7 561 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-551P-201ENST00000516661 TMEM154Q6P9G4 183 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-551P-201ENST00000516661 Q6ZSV7 163 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-551P-201ENST00000516661 LINGO2Q7L985 606 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-551P-201ENST00000516661 ZNF367Q7RTV3 350 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-551P-201ENST00000516661 HUS1BQ8NHY5 278 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-551P-201ENST00000516661 SCFD2Q8WU76 684 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-551P-201ENST00000516661 VCPIP1Q96JH7 1222 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-551P-201ENST00000516661 SLITRK1Q96PX8 696 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-551P-201ENST00000516661 KAT14Q9H8E8 782 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-551P-201ENST00000516661 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-551P-201ENST00000516661 HAUS2Q9NVX0 235 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-551P-201ENST00000516661 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-551P-201ENST00000516661 IL36RNQ9UBH0 155 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-551P-201ENST00000516661 H3BNX3 289 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-551P-201ENST00000516661 VWA5AO00534 786 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-551P-201ENST00000516661 ITM2AO43736 263 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-551P-201ENST00000516661 GFPT2O94808 682 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-551P-201ENST00000516661 NIPAL4Q0D2K0 466 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-551P-201ENST00000516661 CRYMQ14894 314 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-551P-201ENST00000516661 MEA1Q16626 185 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-551P-201ENST00000516661 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-551P-201ENST00000516661 C6orf141Q5SZD1 244 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-551P-201ENST00000516661 ZNF425Q6IV72 752 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-551P-201ENST00000516661 SARM1Q6SZW1 724 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-551P-201ENST00000516661 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-551P-201ENST00000516661 C1QL2Q7Z5L3 287 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-551P-201ENST00000516661 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-551P-201ENST00000516661 SLC35F3Q8IY50 421 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-551P-201ENST00000516661 TTC39CQ8N584 583 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-551P-201ENST00000516661 ZBTB2Q8N680 514 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-551P-201ENST00000516661 SCCPDHQ8NBX0 429 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-551P-201ENST00000516661 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-551P-201ENST00000516661 WDFY2Q96P53 400 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-551P-201ENST00000516661 TKTL2Q9H0I9 626 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-551P-201ENST00000516661 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-551P-201ENST00000516661 GHITMQ9H3K2 345 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-551P-201ENST00000516661 SH2D4AQ9H788 454 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-551P-201ENST00000516661 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-551P-201ENST00000516661 TMEM51Q9NW97 253 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-551P-201ENST00000516661 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-551P-201ENST00000516661 SQORQ9Y6N5 450 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-551P-201ENST00000516661 A6NCN8 305 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-551P-201ENST00000516661 BECN2A8MW95 431 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-551P-201ENST00000516661 B4DGG1 531 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-551P-201ENST00000516661 PTGES3LE9PB15 166 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-551P-201ENST00000516661 SPRY3O43610 288 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-551P-201ENST00000516661 LCATP04180 440 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-551P-201ENST00000516661 LDHCP07864 332 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-551P-201ENST00000516661 RARGP13631 454 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-551P-201ENST00000516661 HOXB2P14652 356 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-551P-201ENST00000516661 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
RNU6-551P-201ENST00000516661 NAGAP17050 411 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-551P-201ENST00000516661 ALOX12P18054 663 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-551P-201ENST00000516661 GPTP24298 496 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-551P-201ENST00000516661 TM4SF1P30408 202 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-551P-201ENST00000516661 RFX2P48378 723 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-551P-201ENST00000516661 F2RL1P55085 397 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-551P-201ENST00000516661 TRAF1Q13077 416 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-551P-201ENST00000516661 MYBPC2Q14324 1141 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-551P-201ENST00000516661 NEDD9Q14511 834 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-551P-201ENST00000516661 USP41Q3LFD5 358 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-551P-201ENST00000516661 FSCBQ5H9T9 825 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-551P-201ENST00000516661 KLHL35Q6PF15 583 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-551P-201ENST00000516661 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
RNU6-551P-201ENST00000516661 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-551P-201ENST00000516661 MIGA1Q8NAN2 632 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-551P-201ENST00000516661 ARRDC2Q8TBH0 407 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-551P-201ENST00000516661 TMEM68Q96MH6 324 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-551P-201ENST00000516661 CMTM3Q96MX0 182 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-551P-201ENST00000516661 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP6.58□□□□□ -1.36
RNU6-551P-201ENST00000516661 FAM234AQ9H0X4 552 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-551P-201ENST00000516661 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
RNU6-551P-201ENST00000516661 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
RNU6-551P-201ENST00000516661 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
RNU6-551P-201ENST00000516661 VPS28Q9UK41 221 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-551P-201ENST00000516661 GPR34Q9UPC5 381 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-551P-201ENST00000516661 ERVK-11Q9UQG0 969 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-551P-201ENST00000516661 MTMR6Q9Y217 621 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-551P-201ENST00000516661 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-551P-201ENST00000516661 CEPT1Q9Y6K0 416 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-551P-201ENST00000516661 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-551P-201ENST00000516661 K7ENM7 598 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-551P-201ENST00000516661 ASAP2O43150 1006 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-551P-201ENST00000516661 HOXD13P35453 343 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-551P-201ENST00000516661 KCNJ4P48050 445 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-551P-201ENST00000516661 PMS2P54278 862 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-551P-201ENST00000516661 SORDQ00796 357 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-551P-201ENST00000516661 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
RNU6-551P-201ENST00000516661 KRT24Q2M2I5 525 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-551P-201ENST00000516661 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
RNU6-551P-201ENST00000516661 FNBP1LQ5T0N5 605 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-551P-201ENST00000516661 QSOX2Q6ZRP7 698 aa6.57□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms