RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516259.1

RNU6-390P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 390, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-390P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-390P-201ENST00000516259 OGFRQ9NZT2 677 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-390P-201ENST00000516259 COPG2Q9UBF2 871 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-390P-201ENST00000516259 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-390P-201ENST00000516259 FBXL17Q9UF56 701 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-390P-201ENST00000516259 PCDHA12Q9UN75 941 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-390P-201ENST00000516259 RAP2CQ9Y3L5 183 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-390P-201ENST00000516259 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-390P-201ENST00000516259 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.86
RNU6-390P-201ENST00000516259 A0A1W2PQ09 198 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 CHL1O00533 1208 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 HS6ST1O60243 411 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 JRKO75564 520 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 CLDN7O95471 211 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 SAT1P21673 171 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 AVPR1AP37288 418 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 HSD17B4P51659 736 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 PNLIPRP2P54317 469 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 F2RL1P55085 397 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 CDH12P55289 794 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 SOWAHAQ2M3V2 549 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 ESCO2Q56NI9 601 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 TMCO3Q6UWJ1 677 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 ZNF793Q6ZN11 406 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 FAM217AQ8IXS0 508 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 POC5Q8NA72 575 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 AGBL3Q8NEM8 1001 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 MOAP1Q96BY2 351 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 ARSGQ96EG1 525 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 DACH2Q96NX9 599 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 SORCS2Q96PQ0 1159 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 MSTO1Q9BUK6 570 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 SCNM1Q9BWG6 230 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 KIF9Q9HAQ2 790 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 BPIFA1Q9NP55 256 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 MSRB1Q9NZV6 116 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 IL36RNQ9UBH0 155 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 RPS6KA6Q9UK32 745 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 NENFQ9UMX5 172 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 CEPT1Q9Y6K0 416 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 MAU2Q9Y6X3 613 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 OR2A25A4D2G3 310 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 TMEM202A6NGA9 273 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 STMND1H3BQB6 276 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 MITFO75030 526 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 ENTPD3O75355 529 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 SOX30O94993 753 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 NUDT3O95989 172 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 HIST1H2ABP04908 130 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 CELA2AP08217 269 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 KRT10P13645 584 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 SELLP14151 372 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 CHRNB2P17787 502 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 HIST1H2ADP20671 130 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 PON1P27169 355 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 ACADLP28330 430 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 SLC15A1P46059 708 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 FASLGP48023 281 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 PTH2RP49190 550 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 LMAN1P49257 510 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 CAMPP49913 170 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 PMS2P54278 862 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 TAS2R40P59535 323 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 ZP1P60852 638 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 ECT2LQ008S8 904 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 ACSM2AQ08AH3 577 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 GRIK3Q13003 919 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 MTX1Q13505 466 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 NAB2Q15742 525 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 TMEM119Q4V9L6 283 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 TCP11X2Q5H9J9 407 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 MORN5Q5VZ52 161 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 ACSM2BQ68CK6 577 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 SLC18B1Q6NT16 456 aa3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.7 ms