RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509018.5

RAPGEF6-208, Transcript of Rap guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAPGEF6, Length 8,357 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF6-208ENST00000509018 ACTR1BP42025 376 aa7.4□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 ACTR1AP61163 376 aa7.4□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 OR5AK3PQ8NH89 298 aa7.4□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 BPIFA3Q9BQP9 254 aa7.4□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 FEM1AQ9BSK4 669 aa7.4□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 AHCYP23526 432 aa7.4□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 GRM5P41594 1212 aa7.4□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 CLK1P49759 484 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 APLP1P51693 650 aa7.4□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 MLLT10P55197 1068 aa7.4□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 PTSQ03393 145 aa7.4□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 MPPE1Q53F39 396 aa7.4□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 STXBP5Q5T5C0 1151 aa7.4□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 ANKRD22Q5VYY1 191 aa7.4□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 ULK2Q8IYT8 1036 aa7.4□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 STK40Q8N2I9 435 aa7.4□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 ZNF398Q8TD17 642 aa7.4□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 GRHL3Q8TE85 626 aa7.4□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 TFAP2BQ92481 460 aa7.4□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 TSC22D3Q99576 134 aa7.4□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 IL12RB2Q99665 862 aa7.4□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa7.4□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 NTSP30990 170 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 AMPD2Q01433 879 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 MTAPQ13126 283 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 RLN3Q8WXF3 142 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 CEP295NLQ96MC4 621 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.232e-7■■■■□ 23.6
RAPGEF6-208ENST00000509018 RBBP8Q99708 897 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 NPAS2Q99743 824 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 IMPAD1Q9NX62 359 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 ENTPD4Q9Y227 616 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 FAM149AA5PLN7 773 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 CCNOP22674 350 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 LSP1P33241 339 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 CNGA3Q16281 694 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 CPXM1Q96SM3 734 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 COPS4Q9BT78 406 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 SLC39A8Q9C0K1 460 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 PIPSLA2A3N6 862 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 PSTPIP1O43586 416 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 DCXO43602 365 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 B4GALT4O60513 344 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 GRIA1P42261 906 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 HSPA7P48741 367 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 NAE1Q13564 534 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 KIAA2013Q8IYS2 634 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 SFRP1Q8N474 314 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 SKA1Q96BD8 255 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 SLC40A1Q9NP59 571 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 GIMAP2Q9UG22 337 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 GLI2P10070 1586 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 TIPRLO75663 272 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 RENBPP51606 427 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 GDF10P55107 478 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 FAM180BQ6P0A1 224 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 ANKRD46Q86W74 232 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 OSTM1Q86WC4 334 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 MCEMP1Q8IX19 187 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 NCSTNQ92542 709 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 TBATAQ96M53 351 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 YY1AP1Q9H869 796 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 GID8Q9NWU2 228 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 SLC17A7Q9P2U7 560 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 J3KR12 359 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 PPP1R37O75864 691 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 CABYRO75952 493 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 CES1P23141 567 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 NEK2P51955 445 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 SEL1L3Q68CR1 1132 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 XYLT1Q86Y38 959 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 BCO2Q9BYV7 579 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 MIOSQ9NXC5 875 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 SEPT3Q9UH03 358 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 ERVK-11Q9UQG0 969 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 S100A3P33764 101 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 WNT3AP56704 352 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 PTENP60484 403 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 RAB8AP61006 207 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 HYIQ5T013 277 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 AGMOQ6ZNB7 445 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 DTX3Q8N9I9 347 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 SLAIN1Q8ND83 568 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-208ENST00000509018 DHRS1Q96LJ7 313 aa7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.3 ms