RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 RABIFP47224 123 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 YPEL5P62699 121 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 PPP2CBP62714 309 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 PPP2CAP67775 309 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 NIPAL4Q0D2K0 466 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC14A1Q13336 389 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 PTK2BQ14289 1009 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 LRRC14Q15048 493 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 PARP6Q2NL67 630 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF567Q8N184 647 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 C1orf216Q8TAB5 229 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 PIH1D2Q8WWB5 315 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 TADA1Q96BN2 335 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 LYSMD1Q96S90 227 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 CDH19Q9H159 772 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 GBA3Q9H227 469 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM9BQ9NQ34 198 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 GDF3Q9NR23 364 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 HACD3Q9P035 362 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 CHKBQ9Y259 395 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 A0A0J9YYE9 177 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 CAPN8A6NHC0 703 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 TLR4O00206 839 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 ENC1O14682 589 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 LIASO43766 372 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 MMP20O60882 483 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 GCATO75600 419 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 TRBC1P01850 177 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 ITGAVP06756 1048 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 ENGP17813 658 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 HLA-DPA1P20036 260 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 LIG3P49916 1009 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 IRX4P78413 519 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 RASGEF1CQ8N431 466 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 DCLK2Q8N568 766 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 CCDC89Q8N998 374 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 LPCAT1Q8NF37 534 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 ACTRT1Q8TDG2 376 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 VOPP1Q96AW1 172 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 RTP4Q96DX8 246 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 EDEM2Q9BV94 578 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 USP29Q9HBJ7 922 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 MAGEE1Q9HCI5 957 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 SNX12Q9UMY4 172 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 PIEZO1Q92508 2521 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 AP3B1O00203 1094 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 WNT9AO14904 365 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 GAS8O95995 478 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 MMP2P08253 660 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF883P0CG24 379 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 C6P13671 934 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 NFKB1P19838 968 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 TGM1P22735 817 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 KELP23276 732 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 HTR1BP28222 390 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 FDFT1P37268 417 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 PAFAH1B1P43034 410 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 PDE1BQ01064 536 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 ACOX1Q15067 660 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 INAVAQ3KP66 663 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 SEL1L3Q68CR1 1132 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 LIPIQ6XZB0 460 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 GSTA5Q7RTV2 222 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 NLRP8Q86W28 1048 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 KIAA2013Q8IYS2 634 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 NRSN1Q8IZ57 195 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM145Q8NBT3 493 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 LRRN4Q8WUT4 740 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC6A18Q96N87 628 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 RUNDC3BQ96NL0 473 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 OSBPL9Q96SU4 736 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 ORAI3Q9BRQ5 295 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 HERPUD2Q9BSE4 406 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM121Q9BTD3 319 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms