RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498438.1

HOXD11-202, Transcript of homeobox D11, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HOXD11, Length 1,259 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-202ENST00000498438 LRRC38Q5VT99 294 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 GAS2L3Q86XJ1 694 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 MARCH9Q86YJ5 346 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 RBFAQ8N0V3 343 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 GALNT15Q8N3T1 639 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 PLD5Q8N7P1 536 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 TSGA13Q96PP4 275 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 SEMA3CQ99985 751 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 ANP32EQ9BTT0 268 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 NLGN3Q9NZ94 848 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 DTLQ9NZJ0 730 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 LRP4O75096 1905 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 A0A1W2PQ67 120 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 TMEM8BA6NDV4 472 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 NEMP2A6NFY4 417 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 ZNF487B1APH4 448 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 SPOPO43791 374 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 PGLSO95336 258 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 LCA5LO95447 670 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 GM2AP17900 193 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 SLC1A1P43005 524 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 INPP5AQ14642 412 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 VSIG1Q86XK7 387 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 CCDC170Q8IYT3 715 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 PHACTR4Q8IZ21 702 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP18.47■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 LMX1AQ8TE12 382 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 FATE1Q969F0 183 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 HDAC11Q96DB2 347 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 TTLL3Q9Y4R7 772 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 OR1A2Q9Y585 309 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 FAM149AA5PLN7 773 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 K7ESM1 405 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 AQP9O43315 295 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 CDK4P11802 303 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 CCNB1P14635 433 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 COMTP21964 271 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 ACP1P24666 158 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 NOP2P46087 812 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 PEX5P50542 639 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 CLDN6P56747 220 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 DAB2P98082 770 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 DSC2Q02487 901 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 MTM1Q13496 603 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 CNGA3Q16281 694 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 ARMC12Q5T9G4 340 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 SLC9A4Q6AI14 798 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 ALG1LQ6GMV1 187 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 RHOT1Q8IXI2 618 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 CCDC13Q8IYE1 715 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 PLA2G15Q8NCC3 412 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 CCNYQ8ND76 341 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 BTN2A2Q8WVV5 523 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 PANX2Q96RD6 677 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 APOOQ9BUR5 198 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 LRRC61Q9BV99 259 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP18.46■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 PHTF1Q9UMS5 762 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 TFR2Q9UP52 801 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 RAI2Q9Y5P3 530 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 FREM2Q5SZK8 3169 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXD11-202ENST00000498438 APOL1O14791 398 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXD11-202ENST00000498438 HLA-DQB2P05538 268 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXD11-202ENST00000498438 NFKBIAP25963 317 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXD11-202ENST00000498438 VIPR1P32241 457 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXD11-202ENST00000498438 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
HOXD11-202ENST00000498438 HADHBP55084 474 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
HOXD11-202ENST00000498438 PPARDQ03181 441 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXD11-202ENST00000498438 ILKQ13418 452 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXD11-202ENST00000498438 NFATC4Q14934 902 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXD11-202ENST00000498438 ACOX1Q15067 660 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXD11-202ENST00000498438 SPA17Q15506 151 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXD11-202ENST00000498438 PRRT3Q5FWE3 981 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXD11-202ENST00000498438 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
HOXD11-202ENST00000498438 APOLD1Q96LR9 279 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXD11-202ENST00000498438 LGMNQ99538 433 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXD11-202ENST00000498438 DUSP23Q9BVJ7 150 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXD11-202ENST00000498438 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
HOXD11-202ENST00000498438 SLC13A1Q9BZW2 595 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXD11-202ENST00000498438 GOLPH3Q9H4A6 298 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXD11-202ENST00000498438 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
HOXD11-202ENST00000498438 SPASTQ9UBP0 616 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXD11-202ENST00000498438 AMACRQ9UHK6 382 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXD11-202ENST00000498438 HEY1Q9Y5J3 304 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXD11-202ENST00000498438 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXD11-202ENST00000498438 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa18.44■□□□□ 0.54
HOXD11-202ENST00000498438 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
HOXD11-202ENST00000498438 SOWAHDA6NJG2 315 aa18.44■□□□□ 0.54
HOXD11-202ENST00000498438 GCATO75600 419 aa18.44■□□□□ 0.54
HOXD11-202ENST00000498438 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms