RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-215ENST00000498284 TMEM204Q9BSN7 226 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRK-215ENST00000498284 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRK-215ENST00000498284 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRK-215ENST00000498284 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRK-215ENST00000498284 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRK-215ENST00000498284 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRK-215ENST00000498284 CAPN7Q9Y6W3 813 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRK-215ENST00000498284 UTYO14607 1347 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-215ENST00000498284 DYTNA2CJ06 578 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-215ENST00000498284 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-215ENST00000498284 SERPINI2O75830 405 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-215ENST00000498284 CLEC3BP05452 202 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-215ENST00000498284 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-215ENST00000498284 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-215ENST00000498284 CD58P19256 250 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-215ENST00000498284 CAPN3P20807 821 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-215ENST00000498284 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-215ENST00000498284 CDAP32320 146 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-215ENST00000498284 RGS2P41220 211 aa4.53□□□□□ -1.68
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PTPRK-215ENST00000498284 THBS3P49746 956 aa4.53□□□□□ -1.68
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PTPRK-215ENST00000498284 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-215ENST00000498284 EGR4Q05215 589 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-215ENST00000498284 TRAF2Q12933 501 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-215ENST00000498284 PDXDC1Q6P996 788 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-215ENST00000498284 KLHL24Q6TFL4 600 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-215ENST00000498284 LCTLQ6UWM7 567 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-215ENST00000498284 FJX1Q86VR8 437 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-215ENST00000498284 SLC35F3Q8IY50 421 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-215ENST00000498284 BEST2Q8NFU1 509 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-215ENST00000498284 ETNPPLQ8TBG4 499 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-215ENST00000498284 PHF21BQ96EK2 531 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF479Q96JC4 524 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-215ENST00000498284 LRFN5Q96NI6 719 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-215ENST00000498284 SLC25A33Q9BSK2 321 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-215ENST00000498284 TKTL2Q9H0I9 626 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-215ENST00000498284 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-215ENST00000498284 KRT84Q9NSB2 600 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-215ENST00000498284 HAO1Q9UJM8 370 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-215ENST00000498284 MKLN1Q9UL63 735 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-215ENST00000498284 CLEC18AA5D8T8 446 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-215ENST00000498284 WNT9BO14905 357 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-215ENST00000498284 HSPA12AO43301 675 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-215ENST00000498284 KCNJ13O60928 360 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-215ENST00000498284 CH25HO95992 272 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-215ENST00000498284 PRSS2P07478 247 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-215ENST00000498284 NGFRP08138 427 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-215ENST00000498284 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-215ENST00000498284 SPARCP09486 303 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-215ENST00000498284 GPTP24298 496 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-215ENST00000498284 LTBQ06643 244 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-215ENST00000498284 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-215ENST00000498284 NEDD9Q14511 834 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-215ENST00000498284 FGFBP1Q14512 234 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-215ENST00000498284 PLCB4Q15147 1175 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-215ENST00000498284 CCNG2Q16589 344 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-215ENST00000498284 ALG11Q2TAA5 492 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-215ENST00000498284 COL28A1Q2UY09 1125 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-215ENST00000498284 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-215ENST00000498284 NEK10Q6ZWH5 1172 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-215ENST00000498284 TMTC3Q6ZXV5 915 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-215ENST00000498284 LINGO2Q7L985 606 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-215ENST00000498284 CLIP4Q8N3C7 705 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-215ENST00000498284 ZBTB2Q8N680 514 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-215ENST00000498284 C9orf106Q8NAJ2 232 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-215ENST00000498284 SCCPDHQ8NBX0 429 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-215ENST00000498284 CLEC18CQ8NCF0 446 aa4.52□□□□□ -1.69
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PTPRK-215ENST00000498284 HUS1BQ8NHY5 278 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-215ENST00000498284 ELP5Q8TE02 316 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-215ENST00000498284 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-215ENST00000498284 GTF3C6Q969F1 213 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-215ENST00000498284 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-215ENST00000498284 SLITRK1Q96PX8 696 aa4.52□□□□□ -1.69
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PTPRK-215ENST00000498284 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa4.52□□□□□ -1.69
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PTPRK-215ENST00000498284 SLC6A13Q9NSD5 602 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-215ENST00000498284 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-215ENST00000498284 WNT16Q9UBV4 365 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-215ENST00000498284 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
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PTPRK-215ENST00000498284 LINC01553A4QN01 128 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRK-215ENST00000498284 TMEM202A6NGA9 273 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRK-215ENST00000498284 LACTBL1A8MY62 500 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRK-215ENST00000498284 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRK-215ENST00000498284 KCNAB3O43448 404 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRK-215ENST00000498284 ZIC3O60481 467 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRK-215ENST00000498284 CHMP24386 653 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRK-215ENST00000498284 ITGB8P26012 769 aa4.51□□□□□ -1.69
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PTPRK-215ENST00000498284 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRK-215ENST00000498284 COMPP49747 757 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRK-215ENST00000498284 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRK-215ENST00000498284 OLR1P78380 273 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRK-215ENST00000498284 SORDQ00796 357 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRK-215ENST00000498284 BNC1Q01954 994 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRK-215ENST00000498284 TRAF3Q13114 568 aa4.51□□□□□ -1.69
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