RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486978.5

CTDSPL-208, Transcript of CTD small phosphatase like, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSPL, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 A0A087X0T9 212 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 A0A1W2PQU0 124 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 ARHGAP42A6NI28 874 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 TLR4O00206 839 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 KRIT1O00522 736 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 YKT6O15498 198 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 DAPK3O43293 454 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 MTSS1O43312 755 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 CBFA2T2O43439 604 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 AP1G1O43747 822 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 MAGEC1O60732 1142 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 SEMA7AO75326 666 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 PPFIA2O75334 1257 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 PCDH8O95206 1070 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 POP4O95707 220 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 FAM228BP0C875 321 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 ADRB3P13945 408 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 AKT2P31751 481 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 CASP14P31944 242 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 GKP32189 559 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 PCK1P35558 622 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 CASRP41180 1078 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 HCAR3P49019 387 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 NDST2P52849 883 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 PDX1P52945 283 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 RHOAP61586 193 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 RAD51Q06609 339 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 OVGP1Q12889 678 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 TRIM14Q14142 442 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 STAT4Q14765 748 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 NFKBIBQ15653 356 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF284Q2VY69 593 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 MYLK3Q32MK0 819 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF805Q5CZA5 627 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 XKR5Q6UX68 686 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 RFX8Q6ZV50 586 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 CLEC14AQ86T13 490 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 IQCHQ86VS3 1027 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 ZSCAN30Q86W11 494 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 HORMAD1Q86X24 394 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 OXR1Q8N573 874 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 NIPA2Q8N8Q9 360 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 MFSD2AQ8NA29 543 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 OR6K2Q8NGY2 324 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 THAP2Q9H0W7 228 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 LRRC19Q9H756 370 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 CA5BQ9Y2D0 317 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 FADS3Q9Y5Q0 445 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 C16orf96A6NNT2 1141 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 H3BRJ5 948 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 SLC31A1O15431 190 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 FFAR2O15552 330 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 PRAMEF11O60813 436 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 TNFSF15O95150 251 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 CLDN1O95832 211 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 IGSF6O95976 241 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 CYP1A2P05177 515 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 UGT2B4P06133 528 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 PRLRP16471 622 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 ERCC2P18074 760 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 DGKAP23743 735 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 IL1R2P27930 398 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 SLC5A2P31639 672 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 ARL4AP40617 200 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 ABL2P42684 1182 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 RPS21P63220 83 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 DPYSQ14117 519 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 DPYSL2Q16555 572 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 TMEM259Q4ZIN3 620 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 BOLA3Q53S33 107 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 CCDC122Q5T0U0 273 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 AFMIDQ63HM1 303 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 SEL1L3Q68CR1 1132 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 CRTC1Q6UUV9 634 aa6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms