RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486016.1

GCFC2-209, Transcript of GC-rich sequence DNA-binding factor 2, human

TSL 3

Gene GCFC2, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GCFC2-209	ENST00000486016	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		3.88	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		3.88	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		3.88	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	CSTL1	Q9H114	145 aa		3.88	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		3.88	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	RASSF1	Q9NS23	344 aa		3.88	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		3.88	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	TINAG	Q9UJW2	476 aa		3.88	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		3.88	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		3.87	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	FAM72C	H0Y354	149 aa		3.87	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	STX2	P32856	288 aa		3.87	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	HDAC4	P56524	1084 aa		3.87	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	ARHGEF6	Q15052	776 aa		3.87	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	FAM72A	Q5TYM5	149 aa		3.87	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	FAM72D	Q6L9T8	149 aa		3.87	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		3.87	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		3.87	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		3.87	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		3.87	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	NFE4	Q86UQ8	179 aa		3.87	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		3.87	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	FAM72B	Q86X60	149 aa		3.87	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	TMEM219	Q86XT9	240 aa		3.87	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	OTULIN	Q96BN8	352 aa		3.87	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	HAUS8	Q9BT25	410 aa		3.87	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		3.87	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		3.86	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	ASPDH	A6ND91	283 aa		3.86	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	LILRA5	A6NI73	299 aa		3.86	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016		F5H423	210 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	PER2	O15055	1255 aa		3.86	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	CEP104	O60308	925 aa		3.86	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	CDH1	P12830	882 aa		3.86	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	NR0B1	P51843	470 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	KRTAP10-3	P60369	221 aa		3.86	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	POSTN	Q15063	836 aa		3.86	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	CES5A	Q6NT32	575 aa		3.86	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	WDR73	Q6P4I2	378 aa		3.86	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		3.86	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		3.86	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		3.86	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		3.86	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		3.86	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	AFG1L	Q8WV93	481 aa		3.86	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	RND1	Q92730	232 aa		3.86	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		3.86	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		3.86	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	FEM1B	Q9UK73	627 aa		3.86	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	GDA	Q9Y2T3	454 aa		3.86	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	ERVK11-1	P61568	191 aa		3.85	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		3.85	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	MTSS1L	Q765P7	747 aa		3.85	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		3.85	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		3.85	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		3.85	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		3.85	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	RUBCN	Q92622	972 aa		3.85	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	SLC32A1	Q9H598	525 aa		3.85	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		3.85	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		3.85	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		3.85	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		3.85	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		3.85	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016		A0A1B0GU03	582 aa		3.84	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	AGA	P20933	346 aa		3.84	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		3.84	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		3.84	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	CCDC174	Q6PII3	467 aa		3.84	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	NOXA1	Q86UR1	476 aa		3.84	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	WDR63	Q8IWG1	891 aa		3.84	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		3.84	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		3.84	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		3.84	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	ALG14	Q96F25	216 aa		3.84	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	LITAF	Q99732	161 aa		3.84	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		3.84	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	MKKS	Q9NPJ1	570 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		3.84	□□□□□ -1.79
GCFC2-209	ENST00000486016	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		3.83	□□□□□ -1.8

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