RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485989.6

TACC3-210, Transcript of transforming acidic coiled-coil containing protein 3, human

TSL 3

Gene TACC3, Length 726 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TACC3-210	ENST00000485989	CLDN6	P56747	220 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	PFN3	P60673	137 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	TCEAL1	Q15170	157 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	KAZN	Q674X7	775 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	DENND2C	Q68D51	928 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	DPPA4	Q7L190	304 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	PARG	Q86W56	976 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	CCDC13	Q8IYE1	715 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	RBFA	Q8N0V3	343 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	TEX26	Q8N6G2	289 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	ASB12	Q8WXK4	309 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	MAML1	Q92585	1016 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	RBM22	Q9NW64	420 aa	Known RBP eCLIP	12.87	□□□□□ -0.35	7e-6	■■■□□ 17.4
TACC3-210	ENST00000485989	KLF15	Q9UIH9	416 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	ALG6	Q9Y672	507 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	TRIM38	O00635	465 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	MATN3	O15232	486 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	SOCS5	O75159	536 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	RECQL5	O94762	991 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	PGLS	O95336	258 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	ALPI	P09923	528 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	C1QTNF9	P0C862	333 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	GM2A	P17900	193 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	MX2	P20592	715 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	FECH	P22830	423 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	DGKA	P23743	735 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	CCNC	P24863	283 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	SUOX	P51687	545 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	THOP1	P52888	689 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	AP1B1	Q10567	949 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	ZBTB17	Q13105	803 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	IHH	Q14623	411 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	LRRC14	Q15048	493 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	ACOX1	Q15067	660 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	CNGA3	Q16281	694 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	DHRS13	Q6UX07	377 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	LIPI	Q6XZB0	460 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	SLC25A45	Q8N413	288 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	PLA2G15	Q8NCC3	412 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	HAUS1	Q96CS2	278 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	HDAC11	Q96DB2	347 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	DESI2	Q9BSY9	194 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	OR1A2	Q9Y585	309 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	KNL1	Q8NG31	2342 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989		A0A0U1RQJ8	604 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	FAM149A	A5PLN7	773 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	PSTPIP1	O43586	416 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	SIGLEC6	O43699	453 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	TRIM16	O95361	564 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	JCHAIN	P01591	159 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	PDHA1	P08559	390 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	CCDC175	P0C221	793 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	CCNB1	P14635	433 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	JUND	P17535	347 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	LHCGR	P22888	699 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	VIPR1	P32241	457 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	C1orf61	Q13536	156 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	INPP5A	Q14642	412 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	LRRC38	Q5VT99	294 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	DAAM2	Q86T65	1068 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	PELI3	Q8N2H9	469 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	KIF18A	Q8NI77	898 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	FAM174A	Q8TBP5	190 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	LMX1A	Q8TE12	382 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	KRT35	Q92764	455 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	TSGA13	Q96PP4	275 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TACC3-210	ENST00000485989	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35

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