RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 CHST7Q9NS84 486 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 TAS2R7Q9NYW3 318 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 KIF17Q9P2E2 1029 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 SLC17A7Q9P2U7 560 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 ZNF69Q9UC07 566 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 VPS51Q9UID3 782 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 HACL1Q9UJ83 578 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 VPS4AQ9UN37 437 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 CDC14AQ9UNH5 594 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 CDY2AQ9Y6F7 541 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 CDY1Q9Y6F8 540 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 MAU2Q9Y6X3 613 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 DCDC2BA2VCK2 349 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 C7orf72A4D263 438 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 GOLGA8IPA6NC78 632 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 MEI4A8MW99 385 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 ZBTB42B2RXF5 422 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 K7ESF4 209 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 WNT10BO00744 389 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 LIASO43766 372 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 KCNJ13O60928 360 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 ZNF254O75437 659 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 MAFO75444 373 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 DAB1O75553 588 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 NDST3O95803 873 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 IFNA16P05015 189 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 SERPINE1P05121 402 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 PGK2P07205 417 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 YES1P07947 543 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 DLATP10515 647 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 PTPRAP18433 802 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 CCND2P30279 289 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 EPHX2P34913 555 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 RCVRNP35243 200 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 TALDO1P37837 337 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 CASP3P42574 277 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 TECP42680 631 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 BTDP43251 543 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 GABRB2P47870 512 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 OR3A3P47888 321 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 DEFA1P59665 94 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 DEFA3P59666 94 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 GPX6P59796 221 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 TNFAIP2Q03169 654 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 GAD2Q05329 585 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 EPS8Q12929 822 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 PMS2P3Q13401 168 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 TFDP1Q14186 410 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 FAM47AQ5JRC9 791 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 RALGPS1Q5JS13 557 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 AGAP6Q5VW22 663 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 GPR107Q5VW38 600 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 PDPK2PQ6A1A2 396 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 MOXD1Q6UVY6 613 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 HACD2Q6Y1H2 254 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 ADGRA1Q86SQ6 560 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 LINC00523Q86TU6 105 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 PLCZ1Q86YW0 608 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 UNC45BQ8IWX7 931 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 PALM2Q8IXS6 379 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 SLC38A6Q8IZM9 456 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 LILRA2Q8N149 483 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 DCLK2Q8N568 766 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 TEX19Q8NA77 164 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 RHOXF1Q8NHV9 184 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 SETD6Q8TBK2 473 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 C1orf54Q8WWF1 131 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 SEPT1Q8WYJ6 367 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 TTC17Q96AE7 1141 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 BTBD6Q96KE9 485 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 AGAP4Q96P64 663 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 PKP2Q99959 881 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 TMEM121Q9BTD3 319 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 ADAM19Q9H013 955 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 MUC13Q9H3R2 512 aa7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms