RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477413.1

CNIH4-208, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene CNIH4, Length 820 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4-208ENST00000477413 DEF6Q9H4E7 631 aa22.75■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 EVA1BQ9NVM1 165 aa22.75■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 SPASTQ9UBP0 616 aa22.75■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 AMACRQ9UHK6 382 aa22.75■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 SALL4Q9UJQ4 1053 aa22.75■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 COQ6Q9Y2Z9 468 aa22.75■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 ASXL3Q9C0F0 2248 aa22.74■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 LMO7DNF2Z398 122 aa22.74■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 GM2AP17900 193 aa22.74■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 MMP13P45452 471 aa22.74■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 NFATC4Q14934 902 aa22.74■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 CCDC157Q569K6 752 aa22.74■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa22.74■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 MARC1Q5VT66 337 aa22.74■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa22.74■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 LRRC61Q9BV99 259 aa22.74■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 BOCQ9BWV1 1114 aa22.74■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 PPIL1Q9Y3C6 166 aa22.74■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 FAM149AA5PLN7 773 aa22.73■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 AKR1B10O60218 316 aa22.73■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 ARHGAP25P42331 645 aa22.73■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 BLKP51451 505 aa22.73■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 KIAA1024LP59773 190 aa22.73■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa22.73■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 MAP7D3Q8IWC1 876 aa22.73■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 RHOT2Q8IXI1 618 aa22.73■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa22.73■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 NSMCE1Q8WV22 266 aa22.73■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 CHP1Q99653 195 aa22.73■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 NOD2Q9HC29 1040 aa22.73■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 INTUQ9ULD6 942 aa22.73■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 TRABD2BA6NFA1 517 aa22.72■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 NEBLO76041 1014 aa22.72■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 ELFN1P0C7U0 828 aa22.72■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 TRIM23P36406 574 aa22.72■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 DAB2P98082 770 aa22.72■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 TRAF2Q12933 501 aa22.72■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 CDCP2Q5VXM1 449 aa22.72■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 MARCH9Q86YJ5 346 aa22.72■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 RBFAQ8N0V3 343 aa22.72■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 PQLC3Q8N755 202 aa22.72■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 RNF214Q8ND24 703 aa22.72■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 MDM1Q8TC05 714 aa22.72■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 NXPE2Q96DL1 559 aa22.72■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 COQ10AQ96MF6 247 aa22.72■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 APOOQ9BUR5 198 aa22.72■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 NRSN2Q9GZP1 204 aa22.72■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 SCUBE2Q9NQ36 999 aa22.72■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 KCTD5Q9NXV2 234 aa22.72■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 B4GALT6Q9UBX8 382 aa22.72■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 PSMD11O00231 422 aa22.71■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 GCATO75600 419 aa22.71■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 PRKCGP05129 697 aa22.71■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 JUPP14923 745 aa22.71■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 NFKBIAP25963 317 aa22.71■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 HK3P52790 923 aa22.71■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 PPARDQ03181 441 aa22.71■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 INPP5AQ14642 412 aa22.71■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 RTP5Q14D33 572 aa22.71■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 ALG11Q2TAA5 492 aa22.71■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa22.71■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 LRRC38Q5VT99 294 aa22.71■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 KCTD6Q8NC69 237 aa22.71■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 ATL2Q8NHH9 583 aa22.71■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 SLC35G2Q8TBE7 412 aa22.71■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 HDAC11Q96DB2 347 aa22.71■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 CCDC42Q96M95 316 aa22.71■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 SLC13A1Q9BZW2 595 aa22.71■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 PHTF1Q9UMS5 762 aa22.71■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa22.71■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 DGKBQ9Y6T7 804 aa22.71■■□□□ 1.23
CNIH4-208ENST00000477413 MATN3O15232 486 aa22.7■■□□□ 1.22
CNIH4-208ENST00000477413 FZD6O60353 706 aa22.7■■□□□ 1.22
CNIH4-208ENST00000477413 PGLSO95336 258 aa22.7■■□□□ 1.22
CNIH4-208ENST00000477413 CPP00450 1065 aa22.7■■□□□ 1.22
CNIH4-208ENST00000477413 CES1P23141 567 aa22.7■■□□□ 1.22
CNIH4-208ENST00000477413 CCNCP24863 283 aa22.7■■□□□ 1.22
CNIH4-208ENST00000477413 HTR1BP28222 390 aa22.7■■□□□ 1.22
CNIH4-208ENST00000477413 SSR1P43307 286 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CNIH4-208ENST00000477413 ADKP55263 362 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CNIH4-208ENST00000477413 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CNIH4-208ENST00000477413 PRRT3Q5FWE3 981 aa22.7■■□□□ 1.22
CNIH4-208ENST00000477413 LVRNQ6Q4G3 990 aa22.7■■□□□ 1.22
CNIH4-208ENST00000477413 LMX1AQ8TE12 382 aa22.7■■□□□ 1.22
CNIH4-208ENST00000477413 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CNIH4-208ENST00000477413 CLPBQ9H078 707 aa22.7■■□□□ 1.22
CNIH4-208ENST00000477413 SPTLC3Q9NUV7 552 aa22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms