RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475527.1

PTPRG-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRG, Length 2,694 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-205ENST00000475527 A0A0J9YYE9 177 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 ACOX3O15254 700 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 SULT1C4O75897 302 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 BAIAP3O94812 1187 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 INSRRP14616 1297 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 TKTP29401 623 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 RPL34P49207 117 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 ATP6V0D1P61421 351 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 YBX1P67809 324 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 GALNT2Q10471 571 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 ZNF470Q6ECI4 717 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 NIPAL1Q6NVV3 410 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 FAM117BQ6P1L5 589 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 HFE2Q6ZVN8 426 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 YIPF2Q9BWQ6 316 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 CCDC68Q9H2F9 335 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 CD320Q9NPF0 282 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 TMEM247A6NEH6 219 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 AURKAO14965 403 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 TSPAN1O60635 241 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 ESRRBO95718 433 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 CYP2A13Q16696 494 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 PCID2Q5JVF3 399 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 TMTC4Q5T4D3 741 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 BTBD8Q5XKL5 378 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 SLC15A3Q8IY34 581 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 SLC45A3Q96JT2 553 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 TEKT5Q96M29 485 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 C3orf30Q96M34 536 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 SNTG2Q9NY99 539 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 TCAF1Q9Y4C2 921 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 TRIM17Q9Y577 477 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 DOCK1Q14185 1865 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 INPP4BO15327 924 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 NCAM2O15394 837 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 SNAP29O95721 258 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 BCL10O95999 233 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 MT-ND1P03886 318 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 PGK2P07205 417 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 CYP51A1Q16850 503 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 CYBRD1Q53TN4 286 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP20.22■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 IFNEQ86WN2 208 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 ADGRG5Q8IZF4 528 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 IPMKQ8NFU5 416 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 ERLEC1Q96DZ1 483 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 FEM1CQ96JP0 617 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 GIMAP2Q9UG22 337 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 I6L893 689 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 CLDN5O00501 218 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 MTSS1O43312 755 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 B4GAT1O43505 415 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 ALDH2P05091 517 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 GPX3P22352 226 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 ARNTP27540 789 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 HOXD12P35452 270 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 CD151P48509 253 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 TMED10P49755 219 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 CD300CQ08708 224 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 TECRLQ5HYJ1 363 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 SPRED1Q7Z699 444 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 MYRFLQ96LU7 910 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 FANCEQ9HB96 536 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 KCNH1O95259 989 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 APBA3O96018 575 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 CHRM3P20309 590 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 CYHR1Q6ZMK1 362 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 KDELC2Q7Z4H8 507 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 LINC00523Q86TU6 105 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 NT5C3BQ969T7 300 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 HDAC11Q96DB2 347 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 ERGIC3Q9Y282 383 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 ARPC2O15144 300 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 BEST1O76090 585 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 SUPT7LO94864 414 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 CPB1P15086 417 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 RPS9P46781 194 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 RABGGTBP53611 331 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 CNTN4Q8IWV2 1026 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 CRYBG2Q8N1P7 616 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 TRPV3Q8NET8 790 aa20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms