RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474230.5

NFU1-209, Transcript of NFU1 iron-sulfur cluster scaffold, human

TSL 3

Gene NFU1, Length 666 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFU1-209	ENST00000474230	COX7A2	P14406	83 aa		5.12	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	AGA	P20933	346 aa		5.12	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	ABCD3	P28288	659 aa		5.12	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	TUBA1B	P68363	451 aa		5.12	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	5.12	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	PTP4A2	Q12974	167 aa		5.12	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	VEPH1	Q14D04	833 aa		5.12	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		5.12	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	5.12	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		5.12	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		5.12	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		5.12	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		5.12	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	WASF1	Q92558	559 aa		5.12	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	FBXL8	Q96CD0	374 aa		5.12	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	RTP4	Q96DX8	246 aa		5.12	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	WWOX	Q9NZC7	414 aa		5.12	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	MPP6	Q9NZW5	540 aa		5.12	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	GOLGA3	Q08378	1498 aa		5.12	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	NOTCH4	Q99466	2003 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230		A0A1B0GVC2	190 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	TSPAN4	O14817	238 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	TNFSF14	O43557	240 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	ETFA	P13804	333 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	XBP1	P17861	261 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	GPT	P24298	496 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	EFNB3	Q15768	340 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	ZNF114	Q8NC26	417 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	LMO3	Q8TAP4	145 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	KLHL29	Q96CT2	875 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	TBATA	Q96M53	351 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	KLHL15	Q96M94	604 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	BBS4	Q96RK4	519 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	KCND2	Q9NZV8	630 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	SARDH	Q9UL12	918 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	PROCR	Q9UNN8	238 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	BTBD18	B2RXH4	712 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	BCAT2	O15382	392 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	MAPKBP1	O60336	1514 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	TF	P02787	698 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	MYBPH	Q13203	477 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	SGO1	Q5FBB7	561 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	XKR9	Q5GH70	373 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	SLC35F3	Q8IY50	421 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	PGBD5	Q8N414	524 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	NFKBID	Q8NI38	313 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	DOCK7	Q96N67	2140 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	UACA	Q9BZF9	1416 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	GAREM1	Q9H706	876 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	ZIC3	O60481	467 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	GAGE7	O76087	117 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	MTA2	O94776	668 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	MMP2	P08253	660 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	GAGE12F	P0CL80	117 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	GAGE12G	P0CL81	117 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	GAGE12I	P0CL82	117 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	CD58	P19256	250 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	SSTR2	P30874	369 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	SHMT1	P34896	483 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	GAGE1	Q13065	139 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	GAGE4	Q13068	117 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	ITGAD	Q13349	1161 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	TCTN1	Q2MV58	587 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	MMEL1	Q495T6	779 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	MTSS1L	Q765P7	747 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	ZC3HC1	Q86WB0	502 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	TDRP	Q86YL5	185 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	BEST2	Q8NFU1	509 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		5.09	□□□□□ -1.59

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