RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468915.5

SLC13A3-209, Transcript of solute carrier family 13 member 3, humanhuman

TSL 5

Gene SLC13A3, Length 1,597 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3-209ENST00000468915 GM2AP17900 193 aa14.92□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 MMP12P39900 470 aa14.92□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 MAGEA9P43362 315 aa14.92□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 LMAN1P49257 510 aa14.92□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 CRADDP78560 199 aa14.92□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 ZBTB16Q05516 673 aa14.92□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 CALCOCO2Q13137 446 aa14.92□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 CUL1Q13616 776 aa14.92□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 ELF2Q15723 593 aa14.92□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 FAM153CQ494X1 144 aa14.92□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 FAM46CQ5VWP2 391 aa14.92□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 ANO7Q6IWH7 933 aa14.92□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 WDR93Q6P2C0 686 aa14.92□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 MICALCLQ6ZW33 695 aa14.92□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 TSPAN33Q86UF1 283 aa14.92□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 IFT20Q8IY31 132 aa14.92□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 TTC30BQ8N4P2 665 aa14.92□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 PBXIP1Q96AQ6 731 aa14.92□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 ADGRE3Q9BY15 652 aa14.92□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 PARD6BQ9BYG5 372 aa14.92□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa14.92□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 B4GALT6Q9UBX8 382 aa14.92□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 RAB21Q9UL25 225 aa14.92□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 A0A1W2PQ67 120 aa14.91□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 CAPN8A6NHC0 703 aa14.91□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 LDB2O43679 373 aa14.91□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 CA4P22748 312 aa14.91□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 MGAT1P26572 445 aa14.91□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 CXCL12P48061 93 aa14.91□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 PXNP49023 591 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 TPMTP51580 245 aa14.91□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 NEK3P51956 506 aa14.91□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 CAV1Q03135 178 aa14.91□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 DMWDQ09019 674 aa14.91□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 CCDC70Q6NSX1 233 aa14.91□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 CRTC1Q6UUV9 634 aa14.91□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 TTC7BQ86TV6 843 aa14.91□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 HDDC3Q8N4P3 179 aa14.91□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 TSTD1Q8NFU3 115 aa14.91□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 RMDN1Q96DB5 314 aa14.91□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 ZNF778Q96MU6 729 aa14.91□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 ITM2CQ9NQX7 267 aa14.91□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 SYBUQ9NX95 663 aa14.91□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 FBXL12Q9NXK8 326 aa14.91□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 KCTD3Q9Y597 815 aa14.91□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 FADS3Q9Y5Q0 445 aa14.91□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 TEX264Q9Y6I9 313 aa14.91□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 TNFRSF10AO00220 468 aa14.9□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 PPFIA2O75334 1257 aa14.9□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 PTPRCAPQ14761 206 aa14.9□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa14.9□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 USP30Q70CQ3 517 aa14.9□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 DPPA4Q7L190 304 aa14.9□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 FBXL6Q8N531 539 aa14.9□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 FRMD1Q8N878 549 aa14.9□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 RUBCNQ92622 972 aa14.9□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 PPP1R16AQ96I34 528 aa14.9□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 TXLNGYQ9BZA5 131 aa14.9□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 FAM129AQ9BZQ8 928 aa14.9□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 MAGEE1Q9HCI5 957 aa14.9□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 SCML1Q9UN30 329 aa14.9□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 PLXNA2O75051 1894 aa14.9□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 ZNF318Q5VUA4 2279 aa14.9□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 TRPM6Q9BX84 2022 aa14.9□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 MROH6A6NGR9 719 aa14.9□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 A8MX80 341 aa14.9□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 APBB3O95704 486 aa14.9□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 DNTTP04053 509 aa14.9□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 PSMA3P25788 255 aa14.9□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 NPY2RP49146 381 aa14.9□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 PTSQ03393 145 aa14.9□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 POU6F1Q14863 301 aa14.9□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 CNGA3Q16281 694 aa14.9□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 HIF1AQ16665 826 aa14.9□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 CCDC38Q502W7 563 aa14.9□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 DENND2CQ68D51 928 aa14.9□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 TSSK4Q6SA08 328 aa14.9□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 RFLNAQ6ZTI6 216 aa14.9□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa14.9□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 CAMKK1Q8N5S9 505 aa14.9□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 DNAAF3Q8N9W5 541 aa14.9□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 RANBP9Q96S59 729 aa14.9□□□□□ -0.02
SLC13A3-209ENST00000468915 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.6 ms