RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467065.1

UBXN4-205, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene UBXN4, Length 334 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-205ENST00000467065 AGAP3Q96P47 875 aa6.68□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 TSGA13Q96PP4 275 aa6.68□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 FAM129BQ96TA1 746 aa6.68□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 OMDQ99983 421 aa6.68□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 ORAI3Q9BRQ5 295 aa6.68□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa6.68□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa6.68□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 TSPYL1Q9H0U9 437 aa6.68□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 NT5MQ9NPB1 228 aa6.68□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 DTLQ9NZJ0 730 aa6.68□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 PAK5Q9P286 719 aa6.68□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 ASIC3Q9UHC3 531 aa6.68□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 RSPH14Q9UHP6 348 aa6.68□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 VPS51Q9UID3 782 aa6.68□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 SARDHQ9UL12 918 aa6.68□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 FZD4Q9ULV1 537 aa6.68□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 SCML1Q9UN30 329 aa6.68□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 WASF3Q9UPY6 502 aa6.68□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 OR51B4Q9Y5P0 310 aa6.68□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 SNX11Q9Y5W9 270 aa6.68□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 A0A0D9SEW6 157 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 A0A1W2PPC4 97 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 LRRC72A6NJI9 287 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 K7ERQ8 282 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 ATP9BO43861 1147 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 PRAMEF11O60813 436 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 PHF2O75151 1096 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 KRT37O76014 449 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 ADH1BP00325 375 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 MT-CO1P00395 513 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 ITGAVP06756 1048 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 TUBBP07437 444 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 CTSLP07711 333 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 C1QTNF9P0C862 333 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 SRCP12931 536 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 C5AR1P21730 350 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 IL4RP24394 825 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 CD27P26842 260 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 ACVRL1P37023 503 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 FDFT1P37268 417 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 GRIA4P48058 902 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 ARSEP51690 589 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 GEMP55040 296 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 IL9RQ01113 521 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 SLC14A1Q13336 389 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 NOMO1Q15155 1222 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 TEAD4Q15561 434 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 ST3GAL2Q16842 350 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 PARP6Q2NL67 630 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 KIF19Q2TAC6 998 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 TEX44Q53QW1 395 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 ARTNQ5T4W7 220 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 C8orf74Q6P047 294 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 ERAP2Q6P179 960 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 FBXL19Q6PCT2 694 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 IL27RAQ6UWB1 636 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 LINGO4Q6UY18 593 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 LIAT1Q6ZQX7 453 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 LINC00523Q86TU6 105 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 NLRP14Q86W24 1093 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 RASGEF1CQ8N431 466 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 SH2D3CQ8N5H7 860 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 PNPLA1Q8N8W4 532 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 DNAAF3Q8N9W5 541 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 OR14C36Q8NHC7 312 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 UBXN4Q92575 508 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 FAF2Q96CS3 445 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 HDAC11Q96DB2 347 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 KRT12Q99456 494 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 LGMNQ99538 433 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 HEPHQ9BQS7 1158 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 SCNM1Q9BWG6 230 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 EBF2Q9HAK2 575 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 TM7SF3Q9NS93 570 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 KLK13Q9UKR3 277 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 DNPEPQ9ULA0 475 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 BTBD3Q9Y2F9 522 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 LRP4O75096 1905 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 FAM187AA6NFU0 413 aa6.66□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 H0Y8X5 98 aa6.66□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 J3KR12 359 aa6.66□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 KCNK1O00180 336 aa6.66□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 RNF103O00237 685 aa6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms