RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449058.6

TOM1-210, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOM1, Length 2,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1-210	ENST00000449058	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		17	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		17	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	RPS27L	Q71UM5	84 aa	Known RBP	17	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		17	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		17	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	17	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		17	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	TRMO	Q9BU70	441 aa		17	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	17	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	RRAGC	Q9HB90	399 aa		17	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	RGS18	Q9NS28	235 aa		17	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	17	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		17	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		17	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		17	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	FAM92A	A1XBS5	289 aa		17	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	17	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	DRGX	A6NNA5	263 aa		17	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	TRIM38	O00635	465 aa		17	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	17	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	17	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	MAGEA11	P43364	429 aa		17	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	PLK1	P53350	603 aa		17	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	IL10RB	Q08334	325 aa		17	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	EFEMP1	Q12805	493 aa		17	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	TRIM32	Q13049	653 aa		17	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	17	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	17	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	FBXL22	Q6P050	247 aa		17	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	ISCA2	Q86U28	154 aa		17	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	17	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	LILRA2	Q8N149	483 aa		17	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	17	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		17	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		17	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	LRGUK	Q96M69	825 aa		17	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	GCNA	Q96QF7	691 aa		17	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	17	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	SARDH	Q9UL12	918 aa		17	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	GABRQ	Q9UN88	632 aa		17	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		17	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	VWA8	A3KMH1	1905 aa		17	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	CCL22	O00626	93 aa		16.99	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	UBFD1	O14562	309 aa	Known RBP	16.99	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	UBD	O15205	165 aa		16.99	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	ARSA	P15289	507 aa		16.99	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	KCNC1	P48547	511 aa		16.99	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	PSME3	P61289	254 aa		16.99	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	PRAME	P78395	509 aa		16.99	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	STX5	Q13190	355 aa		16.99	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	LRP8	Q14114	963 aa		16.99	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	MAPRE2	Q15555	327 aa		16.99	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		16.99	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		16.99	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	LDB1	Q86U70	411 aa	Predicted RBP	16.99	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		16.99	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		16.99	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	PHF21B	Q96EK2	531 aa		16.99	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		16.99	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	16.99	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	KCTD3	Q9Y597	815 aa		16.99	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	PSMD12	O00232	456 aa	Predicted RBP	16.99	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	EOMES	O95936	686 aa		16.99	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	CHN2	P52757	468 aa		16.99	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	NFKB2	Q00653	900 aa		16.99	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	SERINC3	Q13530	473 aa		16.99	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	TLR1	Q15399	786 aa		16.99	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	PPP1R3A	Q16821	1122 aa		16.99	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	LIN52	Q52LA3	116 aa		16.99	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	GPR158	Q5T848	1215 aa		16.99	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		16.99	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	FAM45BP	Q6NSW5	357 aa		16.99	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	CYHR1	Q6ZMK1	362 aa		16.99	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		16.99	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		16.99	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		16.99	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	FAM45A	Q8TCE6	357 aa		16.99	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	ALG9	Q9H6U8	611 aa		16.99	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		16.99	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		16.99	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	OR51F1	A6NGY5	319 aa		16.98	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	FBP2	O00757	339 aa		16.98	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	TBX18	O95935	607 aa		16.98	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	IGLV3-27	P01718	113 aa		16.98	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	INHBE	P58166	350 aa		16.98	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	16.98	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	16.98	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	PARP15	Q460N3	678 aa		16.98	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF678	Q5SXM1	525 aa		16.98	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		16.98	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		16.98	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	PEX13	Q92968	403 aa		16.98	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	ASB9	Q96DX5	294 aa		16.98	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		16.98	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		16.98	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	16.98	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		16.98	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	16.98	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		16.98	■□□□□ 0.31
TOM1-210	ENST00000449058	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	16.98	■□□□□ 0.31

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.8 ms