RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440835.6

PTPRR-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 2,818 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-204ENST00000440835 CFHR1Q03591 330 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 DNAJC3Q13217 504 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 CLEC14AQ86T13 490 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF605Q86T29 641 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 ARHGEF19Q8IW93 802 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 SPACA3Q8IXA5 215 aa6.1□□□□□ -1.43
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PTPRR-204ENST00000440835 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
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PTPRR-204ENST00000440835 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
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PTPRR-204ENST00000440835 SEMG2Q02383 582 aa6.09□□□□□ -1.43
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PTPRR-204ENST00000440835 FAM81AQ8TBF8 368 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 MYEOVQ96EZ4 313 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
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PTPRR-204ENST00000440835 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 SLC17A9Q9BYT1 436 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 MTG2Q9H4K7 406 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 HAUS4Q9H6D7 363 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 ZFATQ9P243 1243 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 SARDHQ9UL12 918 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 LRRC53A6NM62 1247 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRR-204ENST00000440835 WNT9AO14904 365 aa6.08□□□□□ -1.44
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