RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439984.7

PCNX1-202, Transcript of pecanex 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PCNX1, Length 6,988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1-202ENST00000439984 PRAMEF10O60809 474 aa14.71□□□□□ -0.05
PCNX1-202ENST00000439984 AKAP5P24588 427 aa14.71□□□□□ -0.05
PCNX1-202ENST00000439984 NDST1P52848 882 aa14.71□□□□□ -0.05
PCNX1-202ENST00000439984 METTL21CQ5VZV1 264 aa14.71□□□□□ -0.05
PCNX1-202ENST00000439984 FAAH2Q6GMR7 532 aa14.71□□□□□ -0.05
PCNX1-202ENST00000439984 ZNF549Q6P9A3 640 aa14.71□□□□□ -0.05
PCNX1-202ENST00000439984 SHC3Q92529 594 aa14.71□□□□□ -0.05
PCNX1-202ENST00000439984 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PCNX1-202ENST00000439984 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PCNX1-202ENST00000439984 C8orf4Q9NR00 106 aa14.71□□□□□ -0.05
PCNX1-202ENST00000439984 PTGFRNQ9P2B2 879 aa14.71□□□□□ -0.05
PCNX1-202ENST00000439984 HTR3EA5X5Y0 456 aa14.71□□□□□ -0.05
PCNX1-202ENST00000439984 KDM4BO94953 1096 aa14.71□□□□□ -0.05
PCNX1-202ENST00000439984 CXCL8P10145 99 aa14.71□□□□□ -0.05
PCNX1-202ENST00000439984 SLC2A3P11169 496 aa14.71□□□□□ -0.05
PCNX1-202ENST00000439984 BICRALQ6AI39 1079 aa14.71□□□□□ -0.05
PCNX1-202ENST00000439984 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PCNX1-202ENST00000439984 RNF157Q96PX1 679 aa14.71□□□□□ -0.05
PCNX1-202ENST00000439984 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PCNX1-202ENST00000439984 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa14.71□□□□□ -0.05
PCNX1-202ENST00000439984 EXD2Q9NVH0 621 aa14.71□□□□□ -0.05
PCNX1-202ENST00000439984 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PCNX1-202ENST00000439984 CASKO14936 926 aa14.71□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 FMO3P31513 532 aa14.71□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 ZFP28Q8NHY6 868 aa14.71□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 PDCD10Q9BUL8 212 aa14.71□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 CLUHO75153 1309 aa14.71□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 SH3PXD2BA1X283 911 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 ISPDA4D126 451 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 ENDOD1O94919 500 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 YES1P07947 543 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 PRDX6P30041 224 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 RARRES1P49788 294 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 EVX2Q03828 476 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 NDUFAF6Q330K2 333 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 RUNDC3AQ59EK9 446 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 FAM182AQ5T1J6 154 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 LRRC38Q5VT99 294 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 GMCL1Q96IK5 515 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 TRPC4Q9UBN4 977 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 LRFN2Q9ULH4 789 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 FFAR3O14843 346 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 GPR42O15529 346 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 CLPXO76031 633 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 PSKH1P11801 424 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 EPB42P16452 691 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 OTOP1Q7RTM1 612 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 ZNF410Q86VK4 478 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 C4orf32Q8N8J7 132 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 OR52K2Q8NGK3 314 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 VAT1Q99536 393 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 CNPPD1Q9BV87 410 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 MAZP56270 477 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 AP3S1Q92572 193 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 TBCBQ99426 244 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 COQ3Q9NZJ6 369 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 TRAF6Q9Y4K3 522 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 PEX16Q9Y5Y5 336 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 STON1Q9Y6Q2 735 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 UBE2QL1A1L167 161 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 SIGLEC16A6NMB1 481 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 UGT2B11O75310 529 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 CLIC3O95833 236 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 IRF1P10914 325 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 CDH1P12830 882 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 CPB1P15086 417 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 NEPROQ6NW34 567 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 FAM9CQ8IZT9 166 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 ASB2Q96Q27 587 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 LGMNQ99538 433 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 IGSF9Q9P2J2 1179 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 KLQ9UEF7 1012 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 ENOPH1Q9UHY7 261 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 CASZ1Q86V15 1759 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 ZNF536O15090 1300 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 BUD23O43709 281 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 STAU1O95793 577 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 C2P06681 752 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 DEFA5Q01523 94 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 FAM187BQ17R55 369 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 LCN1P1Q5VSP4 162 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 CNTD1Q8N815 330 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 ZFP42Q96MM3 310 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 HOXC10Q9NYD6 342 aa14.7□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 RRN3P2A6NIE6 340 aa14.69□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 RGS14O43566 566 aa14.69□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 SNX4O95219 450 aa14.69□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 OXCT1P55809 520 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms