RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434982.2

ANKRD55-202, Transcript of ankyrin repeat domain 55, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD55, Length 1,518 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55-202ENST00000434982 MAMLD1Q13495 774 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 ZNF284Q2VY69 593 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 INAVAQ3KP66 663 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 SFMBT2Q5VUG0 894 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 NEK5Q6P3R8 708 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 DHRS13Q6UX07 377 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 TREML4Q6UXN2 200 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 TMC6Q7Z403 805 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 CNPY3Q9BT09 278 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 SYT11Q9BT88 431 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 CALN1Q9BXU9 219 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 PCSK1NQ9UHG2 260 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 FADS3Q9Y5Q0 445 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 CACNA1BQ00975 2339 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 USP24Q9UPU5 2620 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 TMEM8BA6NDV4 472 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 C16orf96A6NNT2 1141 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 LINC01387J3KSC0 135 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 TAF4O00268 1085 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 INSIG1O15503 277 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 MAGEC1O60732 1142 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 SERPINC1P01008 464 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 FTLP02792 175 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 UGT2B4P06133 528 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 ITIH2P19823 946 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 PSMA2P25787 234 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 AKT2P31751 481 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 RXRGP48443 463 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 FGL2Q14314 439 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 IQCB1Q15051 598 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 CA9Q16790 459 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 MYLK3Q32MK0 819 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 ZNF542PQ5EBM4 170 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 LRRC73Q5JTD7 316 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 GCNT7Q6ZNI0 430 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 IQCHQ86VS3 1027 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 TMEM145Q8NBT3 493 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 OR2AP1Q8NGE2 309 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 HMCESQ96FZ2 354 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 FEM1CQ96JP0 617 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 KLHL32Q96NJ5 620 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 FUCA2Q9BTY2 467 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 SLC17A9Q9BYT1 436 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 TRIM7Q9C029 511 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 NRSN2Q9GZP1 204 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 RETREG1Q9H6L5 497 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 PARVAQ9NVD7 372 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 MYO6Q9UM54 1294 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 ITM2BQ9Y287 266 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 PTPRBP23467 1997 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 A0A1W2PQC6 194 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 TMEM191CA6NGB0 347 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 IGLON5A6NGN9 336 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 RASA4BC9J798 803 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 NEMP1O14524 444 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 RAD51BO15315 384 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 YKT6O15498 198 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 RASA4O43374 803 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 TMCC1O94876 653 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 GSRP00390 522 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 DESP17661 470 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 NME2P22392 152 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 CDC25BP30305 580 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 TPI1P60174 286 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 RHOAP61586 193 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 RPS21P63220 83 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 KLHL30Q0D2K2 578 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 OVGP1Q12889 678 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 SERINC3Q13530 473 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 NR1I3Q14994 352 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 CYTH1Q15438 398 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 ZNF805Q5CZA5 627 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 KDM7AQ6ZMT4 941 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 Q6ZSR6 202 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 PDZD3Q86UT5 571 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 LUZP1Q86V48 1076 aa8.44□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms