RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 MON1AQ86VX9 555 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC83Q8IWF9 413 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 DRC7Q8IY82 874 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 GPR156Q8NFN8 814 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 DNASE2BQ8WZ79 361 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 BOD1Q96IK1 185 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 ACAP3Q96P50 834 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP6.54□□□□□ -1.36
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PTPRK-211ENST00000429595 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa6.53□□□□□ -1.36
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PTPRK-211ENST00000429595 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa6.53□□□□□ -1.36
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PTPRK-211ENST00000429595 hCG_1984214I3L0E3 225 aa6.53□□□□□ -1.36
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PTPRK-211ENST00000429595 CYP21A2P08686 494 aa6.53□□□□□ -1.36
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PTPRK-211ENST00000429595 GCSHP23434 173 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
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PTPRK-211ENST00000429595 TNFSF9P41273 254 aa6.53□□□□□ -1.36
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PTPRK-211ENST00000429595 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 HSD11B2P80365 405 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 DNAJC3Q13217 504 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 GPR17Q13304 367 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 ILKQ13418 452 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 KIF19Q2TAC6 998 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 MGAT5BQ3V5L5 792 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 CD300LGQ6UXG3 332 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 ATAD1Q8NBU5 361 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 CADM4Q8NFZ8 388 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 SNX19Q92543 992 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 SEMA3CQ99985 751 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 GPR174Q9BXC1 333 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 TRPC7Q9HCX4 862 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 ITPR3Q14573 2671 aa6.53□□□□□ -1.36
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PTPRK-211ENST00000429595 CLEC18AA5D8T8 446 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 ANTXRLA6NF34 631 aa6.52□□□□□ -1.37
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PTPRK-211ENST00000429595 DYNC1I1O14576 645 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 NEMFO60524 1076 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 LARGE1O95461 756 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 MT-CO3P00414 261 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 ITGB6P18564 788 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 RXRAP19793 462 aa6.52□□□□□ -1.37
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PTPRK-211ENST00000429595 KDSRQ06136 332 aa6.52□□□□□ -1.37
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PTPRK-211ENST00000429595 SARM1Q6SZW1 724 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 CLEC18BQ6UXF7 455 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 DSTYKQ6XUX3 929 aa6.52□□□□□ -1.37
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PTPRK-211ENST00000429595 CHPFQ8IZ52 775 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 CLEC18CQ8NCF0 446 aa6.52□□□□□ -1.37
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PTPRK-211ENST00000429595 SKA1Q96BD8 255 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 RAX2Q96IS3 184 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 VCPIP1Q96JH7 1222 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 SLC25A18Q9H1K4 315 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 CXCL16Q9H2A7 254 aa6.52□□□□□ -1.37
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PTPRK-211ENST00000429595 LINC00597Q9H2U6 94 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 CLSTN2Q9H4D0 955 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 GALNT9Q9HCQ5 603 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 CASS4Q9NQ75 786 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 TBCCD1Q9NVR7 557 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 FBXO34Q9NWN3 711 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 HSFX1Q9UBD0 423 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 SLC23A1Q9UHI7 598 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 NID2Q14112 1375 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 HELZP42694 1942 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
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