RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426877.2

TRAPPC5-202, Transcript of trafficking protein particle complex 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC5, Length 765 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC5-202ENST00000426877 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC5-202ENST00000426877 RALGDSQ12967 914 aa23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC5-202ENST00000426877 SPIDRQ14159 915 aa23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC5-202ENST00000426877 GKN2Q86XP6 184 aa23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC5-202ENST00000426877 WDR92Q96MX6 357 aa23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC5-202ENST00000426877 BPIFA3Q9BQP9 254 aa23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC5-202ENST00000426877 TRIM7Q9C029 511 aa23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC5-202ENST00000426877 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC5-202ENST00000426877 HAUS4Q9H6D7 363 aa23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC5-202ENST00000426877 AIPL1Q9NZN9 384 aa23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC5-202ENST00000426877 SSUH2Q9Y2M2 353 aa23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC5-202ENST00000426877 CDRT15L2A8MXV6 281 aa23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC5-202ENST00000426877 CASC3O15234 703 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC5-202ENST00000426877 LRCH4O75427 683 aa23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC5-202ENST00000426877 PRKCGP05129 697 aa23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC5-202ENST00000426877 PRKCIP41743 596 aa23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC5-202ENST00000426877 HCAR3P49019 387 aa23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC5-202ENST00000426877 KIAA1024LP59773 190 aa23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC5-202ENST00000426877 BCL2L1Q07817 233 aa23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC5-202ENST00000426877 C19orf57Q0VDD7 668 aa23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC5-202ENST00000426877 ASIC2Q16515 512 aa23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC5-202ENST00000426877 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC5-202ENST00000426877 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC5-202ENST00000426877 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC5-202ENST00000426877 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC5-202ENST00000426877 PDXPQ96GD0 296 aa23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC5-202ENST00000426877 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC5-202ENST00000426877 GPR34Q9UPC5 381 aa23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC5-202ENST00000426877 ERVH48-1M5A8F1 160 aa23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC5-202ENST00000426877 DFFAO00273 331 aa23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC5-202ENST00000426877 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC5-202ENST00000426877 KLK10O43240 276 aa23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC5-202ENST00000426877 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC5-202ENST00000426877 FTLP02792 175 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC5-202ENST00000426877 ELFN1P0C7U0 828 aa23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC5-202ENST00000426877 AP1S1P61966 158 aa23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC5-202ENST00000426877 DPYSQ14117 519 aa23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC5-202ENST00000426877 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC5-202ENST00000426877 PCSK4Q6UW60 755 aa23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC5-202ENST00000426877 LIPIQ6XZB0 460 aa23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC5-202ENST00000426877 NYAP1Q6ZVC0 841 aa23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC5-202ENST00000426877 DPPA4Q7L190 304 aa23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC5-202ENST00000426877 RD3Q7Z3Z2 195 aa23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC5-202ENST00000426877 LZTR1Q8N653 840 aa23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC5-202ENST00000426877 PLA2G15Q8NCC3 412 aa23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC5-202ENST00000426877 SPOCK2Q92563 424 aa23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC5-202ENST00000426877 CCDC74AQ96AQ1 378 aa23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC5-202ENST00000426877 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC5-202ENST00000426877 PSKH2Q96QS6 385 aa23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC5-202ENST00000426877 SIRPGQ9P1W8 387 aa23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC5-202ENST00000426877 GULP1Q9UBP9 304 aa23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC5-202ENST00000426877 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC5-202ENST00000426877 RABGEF1Q9UJ41 708 aa23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC5-202ENST00000426877 SCINQ9Y6U3 715 aa23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC5-202ENST00000426877 KIF26BQ2KJY2 2108 aa23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC5-202ENST00000426877 CCDC187A0A096LP49 1063 aa23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC5-202ENST00000426877 A0A1W2PQC6 194 aa23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC5-202ENST00000426877 PMS2P1A4D2B8 440 aa23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC5-202ENST00000426877 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC5-202ENST00000426877 ANO6Q4KMQ2 910 aa23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC5-202ENST00000426877 KCTD16Q68DU8 428 aa23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC5-202ENST00000426877 CLEC14AQ86T13 490 aa23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC5-202ENST00000426877 ARL14Q8N4G2 192 aa23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC5-202ENST00000426877 OR6C4Q8NGE1 309 aa23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC5-202ENST00000426877 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC5-202ENST00000426877 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC5-202ENST00000426877 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC5-202ENST00000426877 ZNF599Q96NL3 588 aa23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC5-202ENST00000426877 CPNE5Q9HCH3 593 aa23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC5-202ENST00000426877 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC5-202ENST00000426877 SEPT3Q9UH03 358 aa23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC5-202ENST00000426877 D6RAR5 112 aa23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC5-202ENST00000426877 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC5-202ENST00000426877 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP23.13■■□□□ 1.291e-8■■■■■ 39.7
TRAPPC5-202ENST00000426877 TNFP01375 233 aa23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC5-202ENST00000426877 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC5-202ENST00000426877 GM2AP17900 193 aa23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC5-202ENST00000426877 PCK1P35558 622 aa23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC5-202ENST00000426877 RENBPP51606 427 aa23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC5-202ENST00000426877 RHDQ02161 417 aa23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC5-202ENST00000426877 TCEA2Q15560 299 aa23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC5-202ENST00000426877 TMCO4Q5TGY1 634 aa23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC5-202ENST00000426877 OR56A4Q8NGH8 313 aa23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC5-202ENST00000426877 ZNF653Q96CK0 615 aa23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC5-202ENST00000426877 TRIM11Q96F44 468 aa23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC5-202ENST00000426877 NSMCE3Q96MG7 304 aa23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC5-202ENST00000426877 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC5-202ENST00000426877 ZWILCHQ9H900 591 aa23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC5-202ENST00000426877 TMEM63CQ9P1W3 806 aa23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC5-202ENST00000426877 TMEM202A6NGA9 273 aa23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC5-202ENST00000426877 TNFRSF10CO14798 259 aa23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC5-202ENST00000426877 ITGA2BP08514 1039 aa23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC5-202ENST00000426877 MYBL1P10243 752 aa23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC5-202ENST00000426877 KELP23276 732 aa23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC5-202ENST00000426877 TRIM23P36406 574 aa23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC5-202ENST00000426877 SCNN1BP51168 640 aa23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC5-202ENST00000426877 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC5-202ENST00000426877 LBRQ14739 615 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC5-202ENST00000426877 DPYSL2Q16555 572 aa23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC5-202ENST00000426877 FILIP1LQ4L180 1135 aa23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms