RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ITGB2P05107 769 aa13.25□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRKCGP05129 697 aa13.25□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CALB1P05937 261 aa13.25□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GLB1P16278 677 aa13.25□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ITIH1P19827 911 aa13.25□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLK7P49862 253 aa13.25□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIAA1024LP59773 190 aa13.25□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SCYL2Q6P3W7 929 aa13.25□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZSWIM9Q86XI8 627 aa13.25□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM159Q96B96 161 aa13.25□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MS4A3Q96HJ5 214 aa13.25□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa13.25□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FGF22Q9HCT0 170 aa13.25□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NLRC4Q9NPP4 1024 aa13.25□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FZD10Q9ULW2 581 aa13.25□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UNC13CQ8NB66 2214 aa13.25□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa13.24□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM202A6NGA9 273 aa13.24□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CYSRT1A8MQ03 144 aa13.24□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EPHB6O15197 1021 aa13.24□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRAMEF10O60809 474 aa13.24□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PNLIPP16233 465 aa13.24□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AIF1P55008 147 aa13.24□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa13.24□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C14orf28Q4W4Y0 310 aa13.24□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MANEAQ5SRI9 462 aa13.24□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OGFOD3Q6PK18 319 aa13.24□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 XKR5Q6UX68 686 aa13.24□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPRED1Q7Z699 444 aa13.24□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TAF8Q7Z7C8 310 aa13.24□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CAMK1DQ8IU85 385 aa13.24□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLA2G15Q8NCC3 412 aa13.24□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR56A4Q8NGH8 313 aa13.24□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR1E3Q8WZA6 343 aa13.24□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EXTL1Q92935 676 aa13.24□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa13.24□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRRC19Q9H756 370 aa13.24□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SEPT10Q9P0V9 454 aa13.24□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CFAP69A5D8W1 941 aa13.23□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SIGLEC16A6NMB1 481 aa13.23□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 B4DGG1 531 aa13.23□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 J3KR12 359 aa13.23□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AGRPO00253 132 aa13.23□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARHGAP6O43182 974 aa13.23□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRAMEF11O60813 436 aa13.23□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KELP23276 732 aa13.23□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SERPINA4P29622 427 aa13.23□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ETV5P41161 510 aa13.23□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STAT1P42224 750 aa13.23□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RALGDSQ12967 914 aa13.23□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP13.23□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DNAJC24Q6P3W2 148 aa13.23□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MON1BQ7L1V2 547 aa13.23□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLITRK4Q8IW52 837 aa13.23□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SFTPA2Q8IWL1 248 aa13.23□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM46DQ8NEK8 389 aa13.23□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MCEEQ96PE7 176 aa13.23□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CMKLR1Q99788 373 aa13.23□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRIM4Q9C037 500 aa13.23□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VPS16Q9H269 839 aa13.23□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa13.23□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STARD5Q9NSY2 213 aa13.23□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FOXJ2Q9P0K8 574 aa13.23□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRIT1Q9P2V4 623 aa13.23□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa13.23□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNF215Q9Y6U7 377 aa13.23□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HECTD1Q9ULT8 2610 aa13.23□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa13.23□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANKRD62A6NC57 917 aa13.23□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ELFN1P0C7U0 828 aa13.23□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HTR7P34969 479 aa13.23□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RGRP47804 291 aa13.23□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CSNK1DP48730 415 aa13.23□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CSRP3P50461 194 aa13.23□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NDST2P52849 883 aa13.23□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAPK10P53779 464 aa13.23□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TPI1P60174 286 aa13.23□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAP9Q49MG5 647 aa13.23□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa13.23□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa13.23□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SRLQ86TD4 932 aa13.23□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VASH2Q86V25 355 aa13.23□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZFAND4Q86XD8 727 aa13.23□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ECHDC3Q96DC8 303 aa13.23□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM168Q9H0V1 697 aa13.23□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DONSONQ9NYP3 566 aa13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms